很快，日本人修改过的援助条款就发过来了。除了上述条件，日本人还提出了另外几个新条件；第一：华南联邦共和党成立以后，需尽早对北方发动战争，为华日协同作战，华南联邦共和国所用之海陆军兵器、弹药、兵具等，宜采用与日本同式。第二：（华南）政府各项要政聘用日人为有力顾问，地方合办警察，曰军械定数向日本采买，并合办械厂，用其工料。第三：华南联邦共和国为大东亚共荣圈之成员，两国既相提携，而其他外国之对于东亚重要外交事件，则两国宜互先通知协定。第四：条件成熟时，日本对蒙古满洲拥有优先取舍权。
当然，日本政府在新增这些条款的同时，也有帮助华南共和国的计划。如有需要，日本将提供军队参与华南共和国对外（北方政府）作战；同时，日本对此次中华革命党之援助，除去两千万日元之外，还将提供三万支长枪、七十二门野炮、一百二十支机枪及相应的弹药。对此，孙大炮在思索良久之后，还是发电报指示胡汉民接受；不过他也交代胡汉民，日本政府必须在华南联邦共和国宣布成立后要及时给予承认和支持。
八月初，日本政府承诺的第一批军火通过海运经珠江口上岸，随即被孙大炮派人接收。随后第二批、第三批也陆续到达，被孙大炮秘密发往香山、佛山、惠州、广州等地，开始装备他们的人员，准备起事。随着武器的到来，一百余名日本教官也到达华南沿海各省，进入革命党人控制的军队，参与军事训练；华南各地的一些人，也开始了他们或公开或秘密的活动。到八月底，孙大炮等人的准备工作开始了一个大概，距离完成还需要到十月才可以。但此时突然发生的事情，促使孙大炮等人不得不提前行动；这件事就是北京政府最新一期的高层人事任命，徐世昌为总统、段祺瑞为总理，并且离开政府高层已久的赵一天突然就任陆军总长。北京政府开始了新老权力的更替，而这些重大事件，和他孙大炮没有一毛钱关系，这些人上台反倒会压迫革命党的活动空间，这种情况下，孙大炮只能提前发动了自己的暴乱，成立国家。
一九一六年九月十五日，孙大炮在香港对外宣布成立华南联邦共和国；这个华南联邦共和国暂时包括广东广西、福建浙江、江西湖南，云南贵州等八个省份，后续有可能将湖北、江苏、安徽、四川等省份也接纳过去。为了表明自己成立华南联邦共和国的合理性，也是为了对中国广大民众英国过得去的说法，在联邦共和国成立的宣言中，孙大炮特别指明：“我们中国革命有两条路，一是中央革命，二是地方革命。经过这么多年的努力，本党发现，相比中央革命，实行地方革命事半功倍。本着‘海外同志捐钱，国内同志捐命’的想法，我党发动了一次又一次的暴动，但都因时机不对而失败。唯一成功的一次，却被卖国贼袁世凯占了便宜。此时成立华南联邦，是我党和广大海内外华人民众共同的愿望，是......”。
九月十五日下午，广州镇守使陈炳焜扣押广东将军龙济光，宣布就任广东省都督，加入华南联邦共和国。十六日，广西桂林镇守使谭浩明，扣押袁世凯委任的广西督军王祖同，宣布广西加入华南联邦共和国。同日，浙江警察厅厅长、兼浙江全省警务处处长夏超，率领浙江水上警察厅厅长叶焕华、警备统领章燮、章培，警练所所长夏尔屿等，带领数百警察赶走了刚刚到任的浙江将军吴光新，宣布接受孙大炮的领导，浙江省加入华南联邦共和国。
十七日，第十混成旅旅长兼厦门镇守使唐国谟，宣布厦门接受华南联邦的领导；福建下游护**第一支队教练官吴瑞玉在泉州宣布加入华南联邦共和国；赣州镇守使蔡森也宣布加入华南联邦，就连远在美国的谭延闿也发电报回国，号召湖南的家乡父老接受孙大炮的宣言，脱离北京政府，加入华南国。尽管这些省份大多数地方表面上没有什么反应，但暗地里各种势力都在角力活动着，一时间整个华南地区流言四起人心惶惶，都显得不那么平静了。
刚刚到任的中华民国总统徐世昌，面临着他上任以来的第一次大危机；不过和他这个国家总统比较起来，国家军队的最高领导者赵一天才是这件事情的最终面对者。