后来，王承恩在调查中发现，郭尚友一个县令，凭政绩早就该调任升职，但他却足足干了十几年，就算遇到调任，也是将他调往偏僻常人不远去往之处。
说白了就是政绩低的那些无能之辈上去了，政绩高的如同郭尚友这般反而遭到贬黜，这么奇怪的事儿就很值得东厂的注意。
究其原因，自是当时郭尚友行事得罪了诸多官员、权贵，以致声名不佳，不附东林，更使得他升迁无望。
说来好笑的是，直到魏忠贤所谓“阉党”执政时期，郭尚友才被召往京师开始任实职，直到官至户部尚书。
晚年回乡，逢山东灾荒，潍县尤为严重，郭尚友又尽散家财，煮粥周济灾民，无数饥民得以存活。
崇祯十二年，郭尚友与县令邢国玺集资修城，改土城为石城，并铸铁炮置城四角楼。
崇祯十五年秋，鞑清兵马围攻潍县，郭尚友仍与张尔忠、胡振奇等同县令周亮工固守御敌达三月之久，使县城免遭蹂躏，百姓复得安居乐业。
郭尚友虽削职在家，可就连当地县令都对他尊敬备至。