至战役结束共杀敌一万八千余人。缴获粮食九百三十万斤，匠户八千四百人，车马夫三万七千人，壮丁一万三千人，妇人四万六千人，两府收抚孤儿七百二十人，骡马两万二千匹，牛三千头，猪四千头，羊一万四千只，鸡禽八千，马车一万六千架，平板推车一万一千辆，金银玉器古玩字画难以计数……
我镇战死二百七十人，致残一百六十一人，重伤两千七百人，余者亦尽皆带伤。
该役结束，我镇即越崆峒山，经原路返回铁焰镇，所有剿匪、平乱军功尽皆送于洪承畴所部。
崇祯二年正月，三边总督武之望因固原兵变忧惧交加，病情加重死于西安，主抚派左都御史扬鹤被崇祯升任兵部右侍郎，兼任三边总督。
因固原兵变，原陕西巡抚胡廷宴和延绥巡抚岳和声被罢。在史书记载中，原本要在崇祯三年才被迁任延绶巡抚的洪承畴，因六盘山一战军功显著，被提前加任陕西巡抚。右副都御使张梦鲸巡抚延绥。