随着朱由检的一声令下，秦兵的绝地大反击开始了！
其实以秦兵的实力，又怎会守不住城池。外城的陷落，只不过是一个巨大的“阴谋”！这个“阴谋”的高明之处就在于，流贼不是驱使百姓攻城么，秦兵就欲擒故纵，让他攻进来！
就如同这条计策的制定者李定国预想的一样，攻破外城之后，流贼立即被胜利冲昏了头脑。他们也顾不上驱使百姓了，立即冲进来打算烧杀抢掠一番。
而这条计策得以实施的先决条件，就是秦王庄还拥有一道内城墙，并且比外城墙修筑得更加坚固，也更接近竣工状态。并且由于小了一圈，防御的正面也缩小了，守城变得更加容易。流贼连外城都难以攻破，内城就更是万无一失了。
而秦王庄的重要建筑，除了兵工厂位于外城之外，其他重要建筑、包括绝大多数民居都位于内城。就算放弃了外城，秦王庄仍可维持正常的运转，最重要的是百姓不会暴露在敌人的屠刀之下。即使是兵工厂，工匠和枪支弹药也早转移了，留下的不过是一处空房子而已。
而且在内外城之间的近百座小型堡垒，也首次发挥了重大的作用。这些堡垒的灵感还是来自《地道战》，朱由检用地道把它们全都连接了起来。地上看是孤零零的堡垒，地下却是错综复杂，到处是机关埋伏。秦兵在这里训练久了，当然轻车熟路；可外来的流贼哪里知道厉害，当然是有进无出，有来无回！
先有攻破外城的喜悦，再有堡垒袭扰的焦躁，最后就是攻破内城的诱惑了。李定国料定闯营必有大将来攻城，因此仍让秦兵故意保存实力，直到大批流贼开始攻城，才给其雷霆一击。没想到收获竟是如此之大，生擒闯营前锋大将郝摇旗，这可是李自成手下最能打的将领了。
郝摇旗一被俘，流贼士气浮动。朱由检见机不可失，立即发动反攻命令。内城的城门当即大开，城内的四队骑兵早已等得不耐烦，当即分东、西、南、北四个方向纵马狂奔而出，直取外城的四大城门。
别看流贼在城中晕头转向，秦兵却对每条小街小巷都十分熟悉，再窄的道路也不减速，并且也绝不恋战。在这四股黑色洪流面前，谁敢阻挡谁就得粉身碎骨，因此这四队骑兵就如同劈波斩浪一般，不多时就冲到了城门口处。
与此同时，秦兵的步兵也从城中杀出，内外城之间也伏兵四起，到处开花！原来那些藏身地道的秦兵又从堡垒杀了出来，这次他们却不只是躲在上面放箭放鸟铳了，而是如同猛虎下山一般，直接向外城墙冲去！
而流贼今天本来一直打得顺风顺水，虽然攻入外城后受了点挫折，也没太放在心上，最起码绝对没料到守军还会重新杀出来。
可顷刻之间风云突变，不但守军杀出来了，自己的主将还让人家抓了俘虏，流贼如何能不惊慌？因此立即一片大乱，能逃命的都拼命外城外逃，来不及逃的也只能各自为战，根本组织不起有效的反击。
至于被流贼驱赶着来攻城的老百姓，就更是惊慌失措，甚至连逃跑都不会了。当然，就是想跑，他们也跑不过训练有素、准备充分的秦兵。
而秦兵的目标非常明确，就是首先控制四座城门，进而控制整座外城墙，来个瓮中捉鳖！
在四座城门守卫的，是郝摇旗手下最为精锐的骑兵。他们还不知道郝摇旗已经被俘，但见敌军从里面冲出来，已知道大事不妙。他们也很清楚，如果守不住城门，里面的部队，包括主将在内肯定全得玩完，因此也拼死抵抗起来。
一场秦兵自成军以来前所未有的激战，终于开始了！
此时双方短兵相接，秦兵没有有利的地形，没有火器的优势，更没有兵力的优势，有的只是一往无前的决心！在几员将领的带领下，他们呼喊着狠狠撞入流贼阵中，很快便与流贼混战在了一起。
而趁着这个机会，秦兵的步兵也逐渐接近了外城墙。由于流贼的骑兵全被死死地钉在城门附近，步兵们倒没受到什么阻挡。而且他们虽然推进速度很快，但也一直尽量保持着鸟铳三段击的阵势，就有零星的流贼挡路，也立刻打成了筛子。
此时，城外的李自成也嗅到了危险的气味，立即派出大批流贼向四座城门杀来。就在这千钧一发之际，秦兵的鸟铳手终于抢先登上了城头，突然向城下的流贼抛下了一个个铁球！
流贼哪知道这是什么玩意，还以为只是普通的铁疙瘩，只要不正好砸到脑袋上就行。哪知这些铁球还不等落地，突然发生了猛烈的爆炸！一声声巨响过后，城门内外到处是弥漫的硝烟，而硝烟之中，到处是被炸得血肉模糊的流贼尸体！
这就是朱由检的另一样秘密武器：手榴弹！
其实早在宁远之战中，眼看城破在即之时，朱由检就让守军直接把弹药箱引燃扔下城去，当做简易的手榴弹使用，取得了出人意料的战果。
从那以后，朱由检就一直在琢磨，怎么能制作出正式的、便于使用的手榴弹来。但他依稀记起，前世的手榴弹那都是有引信的，具有延时引爆功能，也就是影视剧中常见的“拉弦”。这东西可有一定的技术含量，至少朱由检自己是做不出来的。
所以他只好让工匠们生产一种简易的替代品，无非就是一个铁壳子里面加上火药，然后用一根药捻与外界相连。使用之时，先点燃药捻，然后赶紧扔出去。由于药捻在飞行