而这一次大中军要远渡南洋到菲律宾这个更为炎热的地区进行作战，防疫问题便会更加严重。
所以肖天健着令兵部，要对此给予高度重视，并且着令太医院抽调大批医官参与到这次行动之中，并且提前准备充足的药品，特别是准备充足的成药和一些防暑、止泻、驱虫的药物做好随军保障，干脆最好是准备一个大型野战医院，随军一起出征，随军进行就地保障。
兵部当然马上表示接受，立即对作战计划进行了修改，至于内阁方面，都没有肖天健了解情况，所以只能同意了这次的作战计划。
于是在天元八年的二月，趁着菲律宾这个时候处于旱季，而且南海暴风雨比较少的时候，大中朝展开了对马尼拉的远征行动。
这一次远征行动，出发地被选在了广州，在七年底刚刚完成了收复台湾之战的南方舰队，立即便开始着手准备远征马尼拉。
几个月间，各地造船厂便又有几十条大型夹板船也就是盖伦船下水交付给了南方舰队，另外还有几十条商用大夹板船也交付给了海贸集团，作为海上贸易船使用，像这样的情况，在天元六年之后，非常普遍。
西方造船工匠们，在这几年中，为大中朝各个造船厂，培养出了一批会建造西式帆船的船匠，而中国工匠的智慧是永远不能被小觑的，这些中国的工匠们，学习能力非常强，他们虽然文化程度不高，但是却善于记忆和总结，更善于将各种所学糅合在一起，所以这些学成的工匠们，很快便可以在各大船厂造出和西方人相媲美的大帆船，甚至于在糅合入了许多中式帆船的制造技术之后，所造出来的帆船，比起西式帆船更加好用一些。
所以这个时代，完全可以称作是中国爆帆船的时代，沿海各地的船厂，几乎每天都有新造出的船只下水，交付给用户使用。
所以海军早年所造的一些旧式帆船，到了这个时候，已经开始大批淘汰，一些船只因为还可以用，便转卖给了渔民充当大型渔船或者普通沿海货船使用，到了这个时候，大中朝皇家海军，基本上已经实现了战船的西式化，海上作战能力大为提高，再加上大批海盗不断的投顺，在接受培训之后，进入海军服役，使得海军方面水手也不再缺乏，战斗力空前的强大了起来。
此次行动不单单是南方舰队的事情，北方舰队方面此次也调派了五十余条各式大型战船和运兵船参战，另外海贸集团方面，这一次也下了老本，集结了公司下属的近百条武装商船参战。
战争对于海贸集团来说，是求之不得的事情，他们早已对马尼拉这个良港垂涎三尺了，另外对于菲律宾所产的各种物资，都是海贸集团所需商品，特别是菲律宾的所产的铜矿、黄麻等物都是抢手货。
发动海外战争的本质就是掠夺，海贸集团看似要白白付出船只人力，来帮着朝廷打仗，但是对于战争胜利之后，朝廷肯定会授权海贸集团监管马尼拉港，所以郑芝龙这个海贸集团总督大人，对此兴奋不已，将手头能动用的武装商船几乎都派给了海军调遣使用。
另外陆师方面派遣的三个陆军师在天元七年底的时候，也开始了集结行动，他们通过陆路或者水路乃至是海路，纷纷抵达了广州一带屯驻，并且在海军的配合之下，在沿海地带选择了几个岛屿，开始了前期的准备训练。
二月份一到，三百多条大型战船和武装商船，以及大型运兵船，全部在广州湾一带完成了集结，随着一声令下，数万人纷纷开始登船，各种物资也纷纷被装载到了船上，在补充完毕之后，庞大的舟师立即鸣炮杨帆，开始驶出了广州湾。
从广州-< >-的舰队，抵达马尼拉港，整整用了半个月的时间，这还是在大批使用了西式快速帆船的之后的结果，如果用老式的中式帆船的话，即便是速度比较快的福船，起码也要二十多天。
在途中，舰队还遭遇了一次比较大的风暴，有三条船只因为相撞，造成了倾覆，损失了数百名水手和士兵，但是即便如此，作为此战的指挥官的刘岩明，还是没有动摇继续前进的决心，终于在半个月之后，率领着巨大的船队出现在了马尼拉湾。
西班牙人的巡逻船也很快发现了大中朝的舰队，看着如同乌云一般遮天蔽日的大中朝的舰队，西班牙人顿时吓得屁滚尿流。
这一战几乎没有什么好说的，在绝对优势兵力面前，西班牙人的抵抗如同荷兰人在台湾时候一样，显得是苍白而且虚弱，现在的西班牙早已不复当年的雄风，在他们的西班牙舰队被英国人击败之后，西班牙人的海上力量便严重的削弱了下去，现在只是勉强维持在亚洲的殖民地而已，对付一下荷兰人，他们还勉为其难，但是面对着兵力数万的大中军，他们区区几千人的兵将和仅仅装备着一些粗陋的原始武器的由当地土著菲猴儿组成的殖民军，根本就不够大中军看的。
所以这一仗仅仅持续了不到十多天的时间，西班牙人的马尼拉总督便宣布了投降，在交出了所有武器和他们的财物之后，残存下来的几百名西班牙人被大中军赶上了两条破船，由他们驾船而去，至于他们能不能回到西班牙或者是其他地方，那就看他们的运气如何了！
大中朝随即在马尼拉附近，对试图抵抗的当地土著进行了一场大规模的清剿，这种清剿也可以说成为一种屠杀吧！凡是殖