看到外城百姓许多人为此流离失所，肖天健于是便下令先进行安民，将流离失所的百姓先迁到城外借出一批刑天军的兵帐供其临时安置，同时下令发放赈济粮食，让流离失所的百姓可以先吃到东西，以免出现大批的饿死的情况，至于家没有被毁的，则也尽量权其离家出城躲避，实在不想走的，刑天军也尽量不予骚扰。
为了尽快安定民心，刑天军还抓了一大批趁乱行掠的溃兵，在外城各处斩首示众，如此一来算是稳定住了南京外城的局势。
果不其然随着外城失守，刑天军马上便面临着几十万人张嘴吃饭的问题，丁启睿为了控制外城官军，还有防止刑天军夺占外城之后获取粮秣，将原来南京一带的粮仓中的粮食尽数都移入到了内城之中，刑天军夺下外城之后，便要解决这么多人吃饭的问题，如果不是提前得知消息，做了一定的准备的话，那么刑天军这次即便是攻下外城，估摸着也会很快造成大面积的饥荒，饿死一大批人士没有一点问题的。
也幸亏了蒋勤那帮负责情报的人员提前探知了这一点，在刑天军攻城之前，从各地大批转运来了粮食，这才使得他们没有顿时陷入到狼狈的境地之中。
在外城拿下来之后，刑天军实行了严格的配给制度，每户人家根据人口多寡每天给粮一斤到两斤，这点粮食虽然吃不饱，但是熬成粥起码可以让百姓们饿不死，保证了他们最低的需求，在这一点上，刑天军的做法还是得到了南京百姓的欢迎，很快百姓的恐慌情绪便稳定了下来，偷抢的事情迅速的降低了下来。
而且刑天军方面也张榜告知这些南京百姓，如果他们帮着刑天军攻打内城的话，另外还可以获取更多的粮食来养家糊口，于是许多原来南京城的百姓便为了吃饱肚子，开始转而帮着刑天军为攻打内城做准备。
到了这个时候内城之中也早已停止了以前的那种歌舞升平的活动，大街小巷上的商铺都纷纷关张，包括哪些秦淮河两岸的勾栏妓院，到了这会儿也都变得萧条了起来，城中的每个人都为自己的生存开始担忧了起来。
肖天健下令通告城内守军，令其立即放弃抵抗，打开城门献降，以此减少不必要的死伤，刑天军可以确保他们的生命安全，包括南京的官员，只要投降，都可以确保他们不受侵扰，保护他们的家产。
可是这样的劝降却基本上没有起到多大的作用，城中的那些南京官员之中大部分人不相信肖天健的话，他们认为刑天军仇视他们，一旦投降肯定不会轻饶他们，所以大部分官员不肯投降。
于是肖天健无奈之下，只得继续采取强攻的方式，来攻克南京内城，在和众将商议之后，又实际看到了内城的坚固程度之后，肖天健决定放弃攻打南京城最坚固的聚宝门等几个最坚固的城门，将所有精力都放在了城北的定淮门方向，在一番准备之后，南京城的最后一战终于在九月十日这一天开始打响。
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