孙立人第二天早上，再一次来到明阳山草山行宫的废区，他命令第四军官训练班从新一军调来的一百多名参加缅甸过作战时期的训练班的教员。他命令自己的这些老部下，再认真清理一遍废区，一定要查明蒋介石的下落，尤其是要注意总统行宫中到底有没有地下通道，他告诉自己几个绝对亲信，如果有地道，在地道中要发现“可疑的人”不用请示，予以击毙，然后毁尸灭迹。
在中午时，搜查终于有了结果，在草山行宫原来中庭的小花圃旁边，发现了一个设计的很隐蔽，但已被炸塌了的一条地道。孙立人的这些亲信随后钻了进去，在这条长达280多米的地道里没有发现任何人，只是发现了几箱故宫博物馆的文物和一吨左右的黄金，320多万美元现金。最后在阳明山上的宪兵大队队部的废区中好不容易的钻了出来，在宪兵大队队部的废区中除了找到了12具尸体和部分人体的残骸外，在没发现什么有价值的线索。
孙立人不甘心的命令第四军官训练班的学员队，在明阳山周围的山上进行地毯式搜查，绝不放过任何一个角落，对于蒋介石一定要活见人，死见尸。
孙立人随后以国民党陆军总司令的名义，调集了自己能信得过的190师火速进入台北。21曰晚8点，在陆军总部小礼堂，召集了台湾岛上的陆海空师以上的将领开会。在会上他宣布，昨晚总统官邸遭遇空袭，蒋介石总统在空袭中身亡。为了不使台湾发生动乱，自己身为陆军总司令，在此时必须承担起对国家的责任来。现在他决定对整个台湾进行军管。并成立了以自己为首和各军种的参谋长为副的台湾军事管制委员会。
会议开了三个多小时，与会的有些将领表示一定服从军管会的领导，共赴国难；也有些将领对军管会的合法姓表示质疑，但真正表态的人并不多，绝大部分人持着观望的心态。但不管怎么说，孙立人是国民党陆军总司令，是现在露脸的军方最高领导人，出来主持大局也是理所当然的。对于他的命令在没有更高层的人物和组织出来之前绝大多数的将领还是表示服从的。
不管是什么人总是怀有有一定的野心，有些野心就是自己在客观条件不具备的情况下都不知道，但当外界条件适宜时，这种野心就会显露出来，就会膨胀。孙立人从未担任过任何行政职务，在党务和财经系统也无亲信干部，在国民党内军内人脉也不是很旺，对那些老资格资历的将领相比也只是平平，他本人在台湾并不具备号令四方的个人威望，而对军队也只是控制其中一极少部分。但他此时他感到台湾就在自己的掌控之中了。在洋洋得意之时，难免会有些忘乎所以自我膨胀。山中无老虎猴子称大王，他也不免做起了在台湾称大王的美梦来了。本来和解放军粤闽前线指挥部约定好了，除掉蒋介石及国民党军政要员后，由他掌握台湾军权后宣布起义，迎接解放军进岛。可是当他真的掌握了台湾的权利后，就又想为自己争取更多的权利和利益。
会后他致电解放军粤闽前线指挥部，表示愿意以周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针，进行和[***]进行谈判。对解放军进入台湾岛的问题只字不提。对解放军粤闽前线指挥部进岛的要求也是以各种借口一拖再拖。9月25曰粤闽前线指挥部致电孙立人，让他在27曰前，派台湾高层人士前来澎湖岛洽谈解放军进岛问题。
孙立人上台第一件事就是从监狱中把被蒋介石关押近三年的原新七军军长李鸿和夫人马真和原新七军将校级军官陈鸣人，彭克立，等人放了出来委以重任。
27曰孙立人派李鸿，陈鸣人代表自己前来澎湖岛想就周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针和我军进行谈判。到了澎湖岛后，他们事先会见了，先期到达的国天亮和陈光。当国天亮听了李鸿，陈鸣人等人说明了孙立人的想法后，摇了摇头说：“这事恐怕没有总座想的那么简单。当初我和总座研究时，想能不能象张学良西安事变那样，先把蒋家父子先抓起来，然后和[***]谈判接受周恩来得和平解决台湾十条方针。但算来算去我们没有那个力量。台湾没有一支我们自己能真正掌握的部队。兵临城下要想弟兄们能有个好的前途，只有反蒋起义这一条路可走。我来到澎湖后，解放军制定了斩首行动计划，在打掉国民党首脑后，让总座借此机会控制台湾的军事指挥权，随后撤出沿海前沿滩头阵地，迎接解放军进军台湾。如果总座不能控制台湾的全部军事指挥权，则令能控制的部队撤出滩头阵地，迎接解放军进岛。由解放军自行解决台湾岛内敢于顽抗的部队。对于总座和我们这些人，[***]方面也都做了具体的安排，原则是愿意留在军队的可以继续留在军队；不愿意留在军队的可以在中央和地方安排新的工作，总之时官阶和待遇比在国民党只高不低。但现在总座想按周十条来处理台湾问题，[***]恐怕不会答应。另外，我还要告诉你们，解放军粤闽前线指挥部，对于总座出尔反尔很不满。你们谈时要注意态度。”国天亮想了想又说“要依我的意见，我们还是按事先和[***]约定的办，这样对谁都好，免得双方军队骨肉相煎，台湾百姓生灵涂炭。据我这几天所了解，[***]决心已定，军力强大，现在没有谁能挡住解放军进军台湾。”接着国天亮讲了这几天在澎湖岛的所见所闻。
接待李