不过这几个月皇帝朱伦奎培植了大批忠于他的官员，在这些官员的帮助下，黄道周被重新启用为
礼部侍郎，三天后皇帝下旨，命黄道周入阁。
入阁可是个大事情，现在内阁中有三个人，马士英、阮大铖与钱谦益，如果再加入一个势必分薄马阮二人的权利，这时阮大铖也知道事情不妙，马上与马士英联合，一同反对黄道周入阁。
不过他们两人的反对并没有什么结果，皇帝朱伦奎下中旨绕过内阁，直接让黄道周入阁。黄道周这时为了对付死敌阮大铖，什么名望气节都不要了，不管朝野非议，马上接过皇帝的中旨上任。
黄道周不愧是反阉党急先锋，上任的第一件事就是上书弹劾阮大铖的铁杆、兵部尚书田仰，说田仰在清军占领扬州之际没有抵抗，而是带人逃回南京。
现在阮大铖成了众矢之的，黄道周上来第一件事就是对付他。马士英看到阮大铖要倒霉，马上落井下石、雪中送屎，弹劾阮大铖另一个铁杆、工部尚书张有誉。这样在东林党与马士英的联合打击下，阮大铖将兵部与工部全丢了，成了一个光杆阁老。
而马士英与东林党在这次党争中大胜，兵部尚书归了刚投降过来的大贪官朱大典，而工部尚书的宝座归了马铖的便宜师父，宋应星。
阮大铖失势后，告假躲在家中休养生息，下一步就是东林党与马士英的争斗了。
第一步就是这个浙江巡抚的人选，接到马铖的推荐信后，马士英也举贤不避亲，推荐自己的妹夫越其杰。而东林党那边却推荐佥都御史罗万象，不过罗万象在弘光元年才是个给事中，资历比越其杰差了一些。但是东林党中这边没有合适人选，这几年因为马士英不余遗力的打击，东林党那些高级官员都被免官回家，现在留在南京的高级官员就那么几个，没办法只好从中级官员中挑选了。
这个巡抚的职位最后归了越其杰，倒不是马士英一方势力强，而是皇帝朱伦奎考虑越其杰在杭州为自己坐了两年的牢。这可是不得了的政治资本，身陷敌营能独善其身，这正是朱伦奎要树立的典型，所以最后选定越其杰当这个极其重要的浙江巡抚。
等越其杰的任命传到杭州的时候，马铖早已经带领大军出，杭州的潞王解决了，但是在宁波还有另外一个藩王，那就是在张国维、钱肃乐等浙东官员拥立下，自立监国的鲁王朱以海。
朱以海是南京周围对朱伦奎威胁最小的一个，朱以海的血统与朱伦奎差不多，第一任周王朱橚是朱元璋的第五子，而第一任鲁王朱檀是朱元璋的第十子。虽然血统都很远，但周王朱橚是永乐大帝朱棣的亲弟弟，一个娘生的，自然关系要比鲁王近一些，所以相比朱常淓，朱以海对朱伦奎的威胁要小很多。
不过在小也是威胁，不管怎么样也要消灭，所以圣旨上的说的明白，马铖是代表天子出征，扫平四方不靖，在南京周围第一个不靖就是潞王朱常淓，第二个就是盘踞在浙东的鲁王朱以海。