周世平的信件中，对秦雨田可能遇见的问题，悉数作出了安排。
关于土地问题，周世平授权秦雨田，大胆分配，当然，为了避免不必要的麻烦，也为了后来的继任者便于掌握，土地的所有权悉数归府衙所有，至于台湾岛上原来属于士绅富户所有的土地，趁此机会，一并收归府衙所有，在土地的租赁过程中，要抽调岛上德高望重的老人以及有一定学识的年轻人，共同参与，朝廷征收的赋税不高，待到岛上的百姓明白之后，一定会感激府衙的；关于海盗的问题，原则上不留，对于那些势力庞大、相互纠缠的海盗，一定不能手软，有多少杀多少，海盗的性质不同于士绅、富户，他们大都是打家劫舍起家，本性难移，府衙无法完全掌握，而且，海盗长期好逸恶劳，岛上的海盗数量不多，一定要依靠百姓，彻底消除海盗的隐患，这方面，不要心软，不要怕杀人，必要的时候，可以悬赏，争取在春耕之前，彻底消除海盗的隐患；关于府衙官吏问题，主要依靠岛上的本地人，挑选出色的人，悉数为朝廷所用，知府、同知、通判主要把握大方向就可以了，具体的事宜，让当地人去作，这样，百姓对官府自然有亲切感和依赖感，当然，作的过程，需要秦雨田把握，总之，目的是为了在短期内治理好台湾岛；关于军队的问题，府衙必须和军队有紧密的联系，当然，按照朝廷礼制，军队直接听命于朝廷，府衙不得干涉军队日常事务，军队的主要责任，就是保护台湾府衙安全，防止有其他外来势力侵犯台湾，府衙建设初期，军队会派出军士，协助完成治安等事宜，不过，府衙事务走入正轨之后，军士必须回到军营。
秦雨田看完周世平大人的来信，有些发呆，不知为什么，秦雨田对周世平大人除了尊敬，内心竟然产生了敬畏，这是以前从来没有的。秦雨田是读书人出身，一直以来，心高气傲，表面上谦恭，骨子里傲气，不过，这次到台湾岛，周世平大人准确的分析和布置，令秦雨田肃然起敬，看来，周大人纵横朝廷10几年，不是依靠幸运，而是依靠过人的本领。秦雨田亦为自身之选择高兴，跟着周世平大人干，不会吃亏。
很快，邓大彤来到了府衙，府衙内外已经收拾一新，不过，军营尚在建设中。邓大彤接到了周世平大人的来信，主要内容是关于台湾海盗问题和治安问题。
秦雨田和邓大彤两人商议了足足两个时辰。
开平6年12月18日，府衙发出了第一份告示，言大周朝廷收服了瀛洲，瀛洲更名为台湾，朝廷在台湾设立府衙，秦雨田大人为第一任知府，周富贵为同知，曾建坤为通判，今后，台湾一切事宜，均以府衙告示为准。
大规模的剿灭海盗和招募官吏的事宜同时进行，台湾岛轰动了，每活捉一名海盗，可以赏赐白银10两，粮食一担，这样的奖励，对于贫穷的百姓来说，是巨大的诱惑，不过，不少百姓不知道府衙说话的真假，海盗在岛上横行多年，一般百姓都惧怕他们。
终于有几个不怕事的年轻人，拜别家中父母，横下一条心，捉了两个海盗，奔波几十里，到达瀛洲城，官府的人鉴定之后，毫不犹豫公开给予了奖励，而且，这几个年轻人做梦都没有想到，知府大人、同知大人居然亲自接见他们，招募他们进入了巡捕房做捕快。能够吃官府的饭，这可是祖上积德了，几个年轻人被震晕了。
这件事情传出来，岛上的海盗便没有藏身之处了，各地都有大量的百姓组织起来捉海盗，到开平6年1月20日，台湾岛上的海盗便基本绝迹了。抓获的3000余海盗，秦雨田按照周世平大人信中的安排，进行了公开的审理，凡是身负人命的，一律斩杀，对于海盗头目的家人，实现斩草除根。3000余海盗，最后能够保住性命的，不足500人。虽然岛上杀得鲜血遍地，可是，百姓是异常高兴，瀛洲城甚至专门有一帮人，负责通知其余县爱看热闹的百姓，每遇到斩杀海盗，都要去看热闹。
招募官吏的事宜，秦雨田亲自负责，台湾岛长期被海盗霸占，岛上的百姓，读书人不多，瀛洲城内的府学和各县的学堂，早已经名存实亡，不过，还是有部分读书人，隐居在各地。看见府衙的招募告示，这些人出现了，纷纷到府衙去试探。
秦雨田和周富贵忙的几乎没有睡觉的时间，百废待兴，人手不足，府衙的建设速度稍微快些，下面的各县，基本上海属于停滞状态。秦雨田曾经想着要求朝廷派一部分人来，后来放弃了这个想法，从周世平大人的信中，他悟出了道理，周大人是不会派人来的，就是要求他们任用本地人。纷至沓来的商贾解决了秦雨田的燃眉之急，商贾带来了很多的好东西，布匹、食盐等秦雨田急需的东西，秦雨田毫不犹疑，用缴获的白银购买。
春节之前，府衙和6县的架子总算是搭齐了，6县的知县，都是水师中的读书人担任的，秦雨田也是无奈，让这些人勉强去应付。
趁着春节前的时间，所有招募的官吏都到乡下去了，一是要选好里正，二是要做好耕地、人口的基本情况统计，三是送粮食、送布匹、送食盐、送种子，让百姓安安心心过年，至于春耕，年后招集各村的里正商议。
府衙迅速获得人心，台湾百姓对大周朝廷顶礼膜拜，原来还持观望态度的几个最出名的本地读书人，不再犹豫，直接到府衙，因为府衙如