邓艾本营的将士想要追上囚车救出邓艾，迎接他回成都，卫瓘自认为和钟会一起诬陷邓艾，担心会有变故，就派遣护军田续至绵竹夜袭邓艾于三造亭，杀死邓艾父子。
这时，邓艾就和他大儿子邓忠在一起，二人双双毙命。其余子女在都城，司马昭已经对他们动刀了。家里成年男丁，无一幸免，连同家丁也一同斩首，当然，都是悄然施刑，司马昭深怕张扬出去引起邓艾的亲朋故友反水。
起初，邓艾进入江油时，田续不敢前进，邓艾想要杀了他，不久又放了他，等到卫瓘派遣田续，对他说，“可以报在江油受辱的仇了。”
——这时，可是私心作祟了。而且利令智昏，手段卑鄙。
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益州平定后，朝臣建议对卫瓘加以封赏，卫瓘哪好意思？他助纣为孽，害死了有功之臣。但是他说，“克蜀之功，都是诸将的功劳；而邓艾、钟会二将则是自取灭亡。”
坚持不接受赏赐。
晋王司马炎(晋武帝)建立西晋，这是卫瓘倍受晋武帝信任的时期。他先转任征东将军，不久进爵为菑阳公。
后，卫瓘被改授为都督青州诸军事，兼任青州刺史。
泰始七年(271年)，卫瓘出镇北境，任征北大将军、都督幽州诸军事，兼任幽州刺史、护乌桓校尉。
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卫瓘的女儿出脱得水汪可人，她母亲和卫瓘都给她张罗婚事，可是卫精死活不嫁人，不知为什么，谁问，她也不说。而且，随着年岁的增大，眉结常常窜动，像是有多大的心事似的，问，不说。
卫瓘偷偷对任氏说，“女精是否有属意之人？”
意思是，她有没有偷偷相中哪个小伙子？这样的事，也不是没有过。
任氏想了想，摇摇头，说，“没有。”
卫瓘抽了一口气，说，“男大当婚女大当嫁，这是天经地义的，她为什么不想嫁人？”
任氏说，“我再行透问。”
忙于政务，卫瓘再也没有过问，任氏也就没再提起。
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朝廷听从卫瓘之前的意见，设立平州，后更以他兼督平州。卫瓘举家搬到平洲，在任内又离间北方鲜卑诸部，使“务桓降而(拓跋)力微以忧死”，为朝廷解决了边害。
晋武帝闻知后，对卫瓘大加奖赏。
咸宁四年(278年)，卫瓘被征召入朝，升为尚书令，加侍中。他为人严谨，以严法对待属下，看待诸尚书如同自己的僚佐、尚书郎如同自己的掾属。
卫瓘为政清简，深得朝野上下赞誉。
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武帝将其女繁昌公主下嫁与卫瓘第四子卫宣。两人风风光光成婚，没有人不说郎才女貌，世上无双的。
卫瓘后又领太子少傅，加一千步卒、一百骑兵及鼓吹于府中。
教习了一段时间，卫瓘发现太子智力有问题，傻b呵呵的。他感到得对晋武帝司马炎提及此事，要不然，大晋朝得毁在这个傻孩子手上，但是，这话还不好开口。
后来有一次，晋武帝司马炎在陵云台摆宴，卫瓘假装醉酒，跪在武帝床前说，“臣有事想要说。”
武帝就以为他喝醉了，探过身子问，“您想说什么呢？就说吧。”
卫瓘欲言又止，连续三次，都是磕绊着，不说出来，最后用手抚床说道，“这个座位可惜了!”
武帝怔思再三，只说道，“您真的喝醉了吧？”
从此以后，卫瓘没有再提起过此事。
其实，武帝悟出了他说的意思，就是太子呆痴，他接你的班，你把天下给了他，可惜了。但是，那也没办法，武帝这时，左右不了时政了。
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卫宣娶了公主后，开始还挺好，后来就觉得不对味儿，处处受到公主的制约，离开公主的面，不免沉湎于酒色，放纵一下。
外戚杨骏平素与卫瓘不和，而且自己想要独掌朝政，认为如果卫宣与公主离婚，卫瓘必定逊位辞职，于是与黄门等一起诋毁卫宣，使得武帝下诏让卫宣和公主二人离婚。
卫瓘即惭愧而又惧怕，于是请求告老逊位。
武帝下诏以卫瓘为太保，以菑（zi）阳公身份回家。
有关部门又上奏收捕卫宣交给廷尉，并且罢免卫瓘的官职，武帝不许。后来，武帝才知道是黄门故意构陷卫宣，想要让公主与卫宣复合，而此时卫宣已经因病去世。
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晋惠帝司马衷即位，由太傅杨骏辅政。
元康元年(291年)，杨骏被楚王司马玮矫诏诛杀，作为帝师的卫瓘与汝南王司马亮共辅朝政，录尚书事。被赐予“剑履上殿，入朝不趋”的荣誉。
不久，司马亮上奏建议让诸王回到籓国，与朝臣在殿上议论此事，无人敢应，只有卫瓘附和，司马玮因而记恨卫瓘。
卫瓘和武帝“扶床”的故事传到了贾后的耳朵里，贾南风便以“谋图废立”的罪名，下诏给司马玮，命其免卫瓘官位。
司马玮派清河王司马遐率部包围卫府，众人都怀疑诏书有假，想让卫瓘问清楚再认罪不迟，卫瓘不许，于是与子孙九人一同遇害，享年七十二岁。
只有卫恒的两个儿子卫璪、卫玠在医者家里才躲过一劫，使得卫瓘没有断子绝孙。
卫瓘当初为司空时，曾经斥责帐下督荣晦，等到收捕卫瓘的时候，荣晦也在内，报出卫瓘家人姓名，使其一门九人都无法幸免于难，司马遐不能禁止。
事后，卫瓘之女卫精及国臣重卿们经过百般奔