留下的，就只有小智一人了。
“皮卡丘，你这个样子······看来还是回到最初的样子了吗？”浑身电流四射的皮卡丘就在面前，小智清澈的脸庞没有一丝惧色。他慢慢地走向皮卡丘，“总感觉，又回到了之处见到你的时候啊，皮卡丘。那个时候，我可是遭了不少罪啊。不过自从莫名其妙收服你之后，我也没有多了解你多少。可能是，我在害怕吧。”
“皮卡”癫狂状态的皮卡丘听着小智的话，突然平静了一些，它呆呆地看着走向自己的皮卡丘。
小智来到皮卡丘面前，单膝跪在皮卡丘跟前，伸出手轻轻的摸着皮卡丘的头。溢出的电流，不断刺激着小智的身体，但是小智还是忍着麻痹感，继续摸着。“我也会害怕，你这么强的力量会突然暴走。但是当我面对这样的你时，我反而平静了。嘿嘿，皮卡丘，谢谢之前你的照顾，今后我会更加了解你的，以后，请多多指教了。”小智说着，将皮卡丘抱在了怀里。
“皮卡丘”
巨大的叫声，响彻着附近的海域。撤离圣安奴号的人们，在警船上，都清清楚楚的听到了。
“那是，皮卡丘的叫声。”圣代惊讶地说。
天空骤然变暗，伴随着“轰”地一声，剧烈的能量四射，整艘轮船被四溢的闪电击中，发生了剧烈的爆炸。飞射出的碎片，被警察们用宝可梦挡了下来。
“小···小智他，还在······”圣代惊呆了，双眼一黑，晕了过去。这场爆炸的原因，除了火箭队的几人，没有人知道。佩雷拉踩在潜艇上，看着爆炸的圣安奴号，收起了手中的宝贝球，嘴角上扬说到：“看来，不需要我动手了。这次任务，也算是完成了。”
绫子和杰森险些就卷入了爆炸，没有逃出来。不过杰森还是用三只电系宝可梦逃了出来。绫子本还以为杰森会就她。结果却还是被抛下了。本来也是，杰森本就不认识她，还被她搅乱了不少事情。
最后还是喵喵即使救了绫子。但绫子和喵喵还是被波及到了一点。
后来，千夜带着一部分富人以及警察，在这里为遇难的小智做了哀悼仪式。还有一部分人认为这场灾难，小智只是在添乱，不过这也都是后话了。