随着他的前进，他也发现，自己身后牵着的电缆的拉力越来越强，那是因为原本可以飘荡在水中的电缆，因为长度不够，已经逐渐被他拉直，自然也就导致拉力越来越强。
终于在走过几个转弯之后，电缆彻底无法继续延伸，碇真嗣最后和地面进行了一次联络之后，拔掉了，插在初号机上的电缆，同时来自地面的情报支援也随之断掉，屏幕上出现了一堆雪花，虽然基地厚重的外壳和深水，隔绝了与外界的无线电波，他已经与地表失去联系。
换做以往的话，碇真嗣可能会因此而感到恐惧，感到不知所措，甚至可能会被吓得躲在角落，然后等到氧气耗尽，维生系统无法继续维持，等到初号机暴走，但现在他肯定不会了，失去了电缆的束缚，他的行动反而更加的顺畅。
在探照灯所能够带来的有限的视野下，飞快的深入基地，很快就找到了之前的指挥大厅，他对这里还算是比较熟悉，当初也驾驶着初号机闯进来过一次。
那次是力天使入侵，碇真嗣驾驶初号机在千钧一发之际撞碎了指挥大厅的墙壁，将力天使从指挥大厅中打了出去。
对于这段战斗他的印象还是比较深刻的，在一次次和使徒的对战之中，这也算得上是他的高光时刻了，单挑最强使徒，然后借用发射eva的弹射装置硬生生把两个人送到地面，避免了进一步破坏。
在没有其他两位驾驶员支援的情况下，独自面对力天使甚至是差一点战而胜之，如果不是后来没电了，他真的有可能靠着自己的力量将力天使的s2机关摧毁。
不过也是因为后来没电了，力天使成了诸多使徒之中死的最惨的一个，被硬生生的吃掉了，现在初号机体内正在使用的s2机关，也正是力天使的那一个。
对那场战斗印象深刻的碇真嗣，自然也清晰的记得指挥大厅内部的地形图，事实上那场战斗距离现在并没有太久时间，指挥大厅的一侧墙壁上还能够看到临时将大洞修补起来的预制板。
初号机轻松的将这层临时补上去的墙壁拆开，在指挥大厅的下方，就是三贤人系统的主机，即便是已经被淹没，指挥大厅的地面还闪烁着一阵阵微光，那是设备指示灯，作为人类最重要的堡垒之一，这里的防护是足以对抗核打击的，即便是第三次冲击，也没能让这里的设备停机。
初号机从自己的身上取下特质的大号改锥，开始对基地进行拆除，只要将指挥中心的舰桥拆除下来，就可以取出里面的主机了。
作为在这里生活学习了许久的驾驶员，他对于这片区域还算是比较熟悉，巨大的指挥中心舰桥。此时在他的眼中大小也不过就相当于车辆的引擎盖，只要把几个固定区域的螺栓撬开，就可以将里面的主机取出来了。
只是他并没有注意到主机正在运转，甚至还保留了对基地的相当程度的操控能力。
正常人也不会觉得，已经泡在水里的主机还能做些什么，能让指示灯亮起来就已经相当夸张了。
……
与此同时，一个隐秘的空间之中，一块块石碑浮现出来，石碑上面是一张拥有七只眼睛的面具，蛇，以及苹果，同时还有若隐若现的大脑图案浮现在上面，不同的数字编号代表着不同的人，此时正在这片空间之中交流着。
他们正是新世纪福音战士这个世界中最神秘的组织之一，seele！
一直以来这些人都在暗中掌控着人类，各国的政府内部都有他们的眼线和卧底，科技水平更是首屈一指，技术领先全人类的nerv，也只不过是他们推到前台的特务机构罢了。
此时这些石碑正在闪烁之中交流。
“剧本出现了问题，这次又不是我们期待的结局。”
“那尽快进行重启吧！”
“那孩子正在尝试拯救这个世界，初号机被重新启动了，这也不在剧本之中。”
“不必管他，继续进行重启，尽快派出量产机打捞莉莉丝遗体，亚当胚胎正在苏醒，当他苏醒后，人类就无法成为融合的主导者了，不要节外生枝。”
“但三贤人系统似乎正在作出反应。”
“那个疯女人吗？随他去吧。”
……
完成了这一系列对话之后，石碑又重新暗淡了下去，仿佛什么都没有发生一般，然而，在巨型绫波丽砸出的大坑之中，正有一只只秃鹫一般的量产机，在天空中盘旋，手持量产版的朗基努斯之枪，俯冲到海水之中，尝试对莉莉丝的身体进行打捞。
蓝诺已经观测到了这一幕，不过并没有打算出手，seele能够在一次又一次重启的过程中，将自己的记忆保留下来，那他们自然也可以找到办法将记忆保留。
正好世界重启也可以让那些因为使徒而死去的人复活过来，未必就是一件坏事，阻止seele和这个世界其他的灾难，完全可以在重启之后进行。而且这刚好可以作为对碇真嗣的一场考验……
……
nerv的指挥大厅之中，绿色的指示灯闪烁的越来越急促，紧接着指示灯竟然骤然转化成了红色，整个指挥大厅之中都亮起了醒目的红色灯光，似乎是意味着即将有什么危险要发生。
碇真嗣也感到了极度不安，只觉得整个基地仿佛都对他充满了恶意，此时他已经成功拆除了指挥大厅的外壳，面前那个直径五六米的球体，就是系统的主机了。只要把这东