张居正还告诉秦泰，内阁施行轮班制。内阁阁员除了内阁首辅高拱外，三个人轮流值班。不过张居正的事情比较多，平时大多数的时间都在内阁值班房。张居正每三天轮到一天在这里值夜，其他的两天都会回家休息。昨天刚好轮到张居正值夜，所以张居正已经整整两天一夜没有回家了。内阁行走也要值班，一般每两个内阁行走一班，也采取轮班制值夜。内阁章经不用值班，但是要分班协助内阁阁员办公。一般每一个内阁行走配备一到两名内阁章经，内阁阁员每人配备四名内阁章经，张居正有六名章经协助。六名章经分两班，每一班三人分管政务、军事和民事。在办理交接的时候，每一个人都有各自管理的部门，专人专事不会混乱。
通过张居正的介绍，秦泰终于比较概括的了解了内阁内部分工。内阁阁员就像如今社会的总经理或者部门经理，内阁行走就是经理助理或者是部门主管，内阁章经是经理秘书和或者小弟。要是把大明王朝当一个企业的话，隆庆皇帝就是董事长，皇室就是不参与日常事务的董事，内阁首辅就是公司总经理，内阁次辅是副总经理，内阁三辅是财务总监，内阁四辅是营销总监，内阁行走是协调各部门的监督或者总公司特派代表，六部尚书和侍郎是总公司各部门经理和主管，各地督抚就是总公司下属的各地分公司经理。大家各有各自的地盘和主管方向，相互制约又相互有联系。只不过张居正这个副总经理得到董事长隆庆皇帝的默许，架空了总经理内阁首辅高拱，负责大明王朝这个企业的日常工作和中下层人事任免。
张居正告诉秦泰，内阁现在看上去很忙，其实事情已经少了不少。地方的事务有地方官员管理，一般不是大事或者难事，地方官员不会上报内阁。地方官员和中央机构的关系相当为妙，一般的事情地方官员都是能瞒就瞒，能不上报就不上报。让内阁知道太多的地方不足不但对地方各级衙门不利，而且会影响地方长官的前途。所以除了重要官员的任免和救灾等重大事情必须要上报之外，地方一般不会事事上报。倒是六部衙门，他们会事事上报，目的就是让内阁不要忘记六部主官衙门。一般来说这种关系到六部的事情，内阁可以帮六部主官衙门做主，也可以征求六部相关衙门的主官意见。这就要看内阁的权威和地位高低了。一般的事情，内阁可以代为做主，甚至于直接办理了。但是一些重要事情，必须和六部相关部门通过沟通才可以拍板。特别是关于官员任免和财务支出的事情，一般都要和吏部尚书侍郎或者户部尚书侍郎商量后才可以决定。六部中刑部和工部最好对付，一般不敢违背内阁的意思。兵部需要内阁同意拨款才可以运作，礼部需要内阁批准经费，所以一般也不会和内阁对着干，只有比较嚣张的吏部和户部，有时候经常和内阁有矛盾。不过只要一细想，里面的问题马上就清楚了。吏部是考核和审批中下层官员的衙门，如今内阁收走了任命权，当然导致整个吏部对内阁不满。要不是这里阁员兼任的话，吏部早就和内阁闹翻了。户部管着大明王朝的钱口袋，本来是最有油水的衙门。但是内阁不但拿走了审批权，而且经常对户部查账，所以户部对内阁的意见不小，经常以各种理由为难内阁。还好内阁这几任内阁首辅都是财务方面的个中好手，不但把财务管的井井有条，而且不会上户部的当。但是每一次和户部协调的时候，都是内阁和户部关系最紧张的时候。张居正这些日子主要的精力就是花在如何降服户部主要官员身上。要不是因为这些人的牵制，张居正办事会更加顺利。张居正决定在他担任内阁首辅之前，首先把这个“硬骨头”拿下，让他可以顺理成章的接任内阁首辅。
秦泰发现了一个大问题，为什么所有文件直接送到内阁，而不是通过六部上报内阁呢？要是这些救急文件先交给六部的话，不就要六部求内阁办事了？到时候内阁不但不用求着六部办事，而且事情也会少许多。要知道张居正不光是内阁次辅、礼部尚书，更是兼任着太子太傅，要照顾和教育太子朱翊钧。随着太子朱翊钧渐渐长大，张居正要分心管理朱翊钧的教育和管理。要是张居正被这么多的杂事缠住的话，就没有时间管理朱翊钧了。要知道教育朱翊钧的事情，现在看起来很小，但是实际意义和作用是不可估量的。这不光是影响到张居正和朱翊钧的未来关系，更是影响着朱翊钧的未来执政能力和个人品德。要是张居正能够早日从这些文件中脱离，就早一天可以专心教育好下一代帝王。大明太需要一个英明的帝王了，一个健康又英明的君王绝对会国家和老百姓有利。
秦泰把自己的意见说了出来，张居正马上眼睛一亮。对啊，这么做看上去简单，其实吧麻烦和繁琐推给了六部。六部主官们不敢不接受，也不会不接受，这样不但可以缓和内阁和六部之间的关系，更加让六部官员觉得自己有面子。要是真的这么做的话，内阁就不用再求六部官员，六部官员翻过来要恳求内阁了。张居正等人都是能人，不是没有想过对策，但是没有人这么想过。秦泰虽然不懂政治但是为人简单，总可以一言命中事情的重点和难点。这个主意要是施行的话，内阁可以省下近一半的时间和精力，内阁阁员们也可以由尽可能的抽出时间管理六部中高层官员，分析和研