在浙大的校务会议上，迁校的行程安排已经作了周密的计划。首先从建德乘民船抵达兰溪，再换小船溯梅溪至金华，准备在金华搭火车至江西境内，经樟树，最后抵达赣南的吉安、泰和。
这段原本看上去计划周详的西迁之路，却因战乱，变得异常艰辛。
据回忆，这个时候交通呢是非常困难，实际上后来就是一种最落后的交通技术——人撑着船。
据回忆，老是要上岸的，因为这个摊很浅，这个船人坐的多了以后，有行李什么，船底下会搁牢的，所以要下来走路，那么有的时候就帮着船上的人们拉纤。
12月26日晚上，竺可桢处理完建德的搬迁事务后，最后一个赶到兰溪的萍香旅馆，与带队老师会合。更大的困难摆在面前。
为了节省经费，竺可桢决定大部分师生从兰溪步行至金华，再搭难民车南行。但这个决定却遭到一些教授的反对，因天气寒冷而患风寒的体育系主任舒鸿与家眷较多的梁庆椿不愿前往金华。迁校队伍兵分两路。舒鸿和梁庆椿等人带领一部分女生和家眷走水路至常山，竺可桢则带领大批学生和教员步行至金华，准备搭难民车。
据回忆，一天要八十里路要赶到金华，赶在敌人以前，因为怕日本人，怕日本兵从杭州到江西去，也要走浙赣铁路嘛，我们也要走浙赣铁路，所以我们一天就要赶到这个京华。
据回忆，脚底下都起泡了，都起泡了嘛，教官跟我们一起走的，这些教官他们很懂的，拿了根针，把它火上边烧一烧以后，把泡刺破，刺破了把里面的汁液，把它流掉，流掉了以后，这把皮不好拿掉的，这样子，到了第二天嘛，就好了。
据大伯赵人龙回忆，到金华的话，那个时间，金华的话，这个城里面好多地方人都撤退了，我们记得到金华，到了以后没有地方住，那看到这个中国银行开了大门在那边，一个银行空空如也，空的，所有东西都搬走了，那我们就住在这个中国银行，住了一个晚上。
金华位于浙江腹部，是浙赣铁路线上的军事重镇，自古以来就是兵家必争之地。12月27日中午，竺可桢和一部分教职员工先期抵达金华。金华市内，已经一片萧条，大多数金华市民已经逃离。
下午两点，竺可桢到金华火车站联系车辆。刚到火车站，日军轰炸机飞抵金华上空，轰炸火车站。
日机很快投弹，爆炸声越来越响，忽然一个炸弹落在窗外，震动剧烈，我马上趴到了地上。
未几日机来投弹，渐投渐近渐响，一弹声震窗户，余即伏地。
据回忆，竺可桢一下子趴在地上了，他觉得马上这个下一个炸弹就要落到这个房顶上了。最后就过去了，那个是最后一个炸弹，受了一场虚惊，没炸着，但是可以看到这个形势是很紧张的。
日军轰炸金华后，浙赣铁路运输中断，客货车停开。陆续抵达金华的浙大师生，只能等待途经金华的难民车。但难民车在衢州被军队扣留，转道南昌，用来运输从广西到浙江作战的援兵。师生们被困金华，人心惶惶，一些人不愿再随校西迁。
据回忆，当时农学院有六个教师，就是不辞而别。因为他害怕了，日本人快要打来了，课还没讲完啦，你这个学期没有结束嘛，但是这六个老师呢，他就是说害怕了，我们还是赶紧先跑吧，所以在金华呢，就不辞而别。
经过竺可桢的多方努力，学生们终于在两天后，坐上了一辆开往江西的敞篷铁皮车。
据回忆，没有篷的货车，我们大家就往货车上爬，爬得大家就坐在地下嘛，就坐在火车，又没有凳子又没有什么的，自己带了点干粮，所以又冷又饿。
据回忆，那个时候正是下有冰雪的雨，大家在一个车子里面，那挤得不得了，等于是我睡在你身上，我睡在他身上，这个样子。就是有一个笑话，我们有一个同学，第二天早上觉得脚很痒，脚很痒，他就拿起这个脚来搔，一搔另外一个同学大叫起来，搔错了，不是他自己的脚，是另外一个同学的脚。
据回忆，火车坐到有一个小站叫古芳，古芳的小站火车坏了，停了。停了以后我们好多人都下来推，那当然了，火车怎么能推得动呢，推不动的。
据大伯赵人龙回忆，有那么一个学生调皮得很，看到火车在这个车厢上面的话，白漆漆的字，浙赣，他拿来粉笔上面写几个字，浙字下面加个大，变浙大，赣，赣的上面加的这个迁，迁移的迁，变成浙大迁赣。
凄生坐着这辆敞篷铁皮车，缓缓驶入江西。而另一部分学生和家属员工也已从兰溪坐船抵达常山。
常山是浙江省的西大门，师生们赶到时，正值常山橘子上市的季节，卖橘子的小贩随外可见，但要从这里租车租船到江西玉山，却十分困难。师生们只有到达玉山，才能坐上火车赶往最后的目的地——吉安。情急之下，大多数学生在老师的带领下徒步赶往玉山。
据回忆，常山到玉山的话，这时还要路多了，120里路一天，从天亮走起，走到晚上黑了都还没走到。
玉山位于江西省的最东部，是浙赣铁路总局所在地。12月底，从常山赶来的学生和家属陆陆续续抵达这里。大家兴奋的认为，很快就可以到达目的地吉安了。然而，时处乱世，想要在玉山找到火车，运送浙大师生到吉安附近的樟树镇，却异常困难。
1938年1月1日，新历元旦。玉山火