朝廷之中的暗流突然开始涌动。
开封府城的陷落，让皇上震怒，也让一些人看出皇上对内阁极大的不满，特别是两次的朝会，内阁首辅周延儒认为目前需要稳定局势，暂时不要追究已经过去的事情，团结一致围剿流寇，可这个提议被皇上直接否决，皇上要求追究开封府城陷落的责任。
已经沉默很长时间的东林党人，抓住了这个机会。
蜗居了很长时间的工部右侍郎张溥，都察院右佥都御史张采、杨彝，大理寺右寺丞吴昌时，詹事府右俞德龚鼎孳等人，明锐的把握住时机，开始了行动。
张溥等人是已经遭遇重创的东林党人之中的骨干，内阁大臣钱士升、侯恂等人也是非常看着张溥等人的，朝廷之中发生的任何事情，他们几乎都要告知张溥等人，钱士升等人还曾经努力，让发配到辽东的钱谦益和瞿式耜等人回到京城，可惜机会不成熟，没有能够成功。
就在皇上决定追究开封府城陷落责任的同时，张溥召集张采、杨彝、吴昌时和龚鼎孳等人，详细商议，结合他们掌握的情报，开始提出来弹劾的奏折。
张溥等人的弹劾奏折，在朝中迅速引发了波澜。
按照张溥等人的建议，已故的兵部尚书、五省总督孙传庭，应该要遭受到惩戒，因为其在作战部署的安排方面的失误，直接导致后来的开封府城失陷，已故的河南巡抚吴甡，应该被削去一切的名爵，因为其对开封府城的陷落有着直接的责任，河南总兵贺人龙应该交由刑部和大理寺审讯，其身为河南总兵，未能保住开封府城，明显失职。
至于说朝廷之中，张溥等人也将矛头直接指向了已经辞去内阁大臣、兵部尚书职务的杨嗣昌，剿灭流寇的整体作战部署。是兵部负责的，开封府城的失陷，表明兵部在用人上面和战略部署方面，都出现了重大的失误。杨嗣昌必须要承担主要的责任。
内阁次辅张凤翼也在被弹劾的人员之中，按照内阁首辅和内阁次辅的分工，原则上内阁首辅周延儒协理礼部、吏部和户部的事宜，内阁次辅张凤翼协理兵部、刑部和工部的事宜，兵部出现如此重大的失误。导致开封府城陷落，张凤翼同样有着不可推卸的责任。
张溥等人的奏折，犹如重磅炸弹，不少人认为他们的胆子太大了。
不过内阁首辅周延儒却是暗自佩服，他从弹劾奏折之中，看到了钱士升和侯恂等人的影子，更是看到了钱士升等人揣摩皇上心思的本领。
皇上之所以一定要抓住开封府城陷落的事情，追究相关人员的责任，就是对内阁不满意，希望通过这件事情来整顿内阁。而内阁之中的张凤翼、杨一鹏、杨嗣昌等人，被认为与南京兵部尚书郑勋睿之间的关系不错，皇上早就不满意了，只不过找不到机会发泄而已。
钱士升、侯恂和张溥等人，一定是经过了仔细的分析，切中要害上奏了这份弹劾的奏折，他们在关键的时刻迎合了皇上的心思。
周延儒几乎都是在皇上的身边，他隐隐感觉到了，皇上对郑勋睿和郑家军已经是恨之入骨，日夜担心。要不是因为流寇和后金鞑子的威胁，早就会对郑勋睿和郑家军动手，可就算是局势危急，也不能够眼睁睁看着郑勋睿和郑家军壮大起来。东林党人与郑勋睿之间有着不可调和的矛盾，这个时候启用部分的东林党人，放开手脚去对付郑勋睿，皇上可以居中协调，毫发无损的看着两边厮斗，等到两败俱伤局面出现的时候。出手去收拾郑勋睿。
钱士升和侯恂等东林党人，应该是看清楚了局面，不过为了振兴东林党，为了能够争取到权力，付出一定的牺牲也是值得的，东林党人通过效忠皇上、通过与郑勋睿之间的博弈，来重新发展壮大，未尝不可。
经过了仔细认真的分析，也经过了长时间的思索，周延儒终于下定决心，在皇上决定追究开封府城陷落责任的时候，辞去内阁首辅的职位，让位给东林党人，就让这些东林党人给皇上卖命，与郑勋睿去博弈。
周延儒很清楚，一旦东林党人决定要动手，等待他们的就是覆灭的命运，皇上保不住这些东林党人，关键时刻也不会出手保护，当初在南直隶和淮北等地发生的事情，他记得很清楚，郑勋睿是读书人，不愿意动手杀读书人，那是因为胜券在握，也是希望东林党人能够反省，不过郑勋睿的隐忍换来如此的局面，人家再次动手的时候，还会手软吗。
六月中旬的朝会，足足持续了两整天的时间，这在大明历史上是空前绝后的，朝会上发生了激烈的争论，甚至是争吵，而这次的朝会，也开启了大明皇室迅速衰败的源头，从这个时候开始，朱由检开始走向了一条不归路。
也就是从这次的朝会开始，朱由检做出了一个决定，司礼监的太监参与到朝会之中，可以明确的发表意见建议。
这个大胆的决定，让不少的朝臣反对，毕竟先皇的时候，魏忠贤尽管是权倾朝野，但也没有参加过朝会，表面上还是要维持皇室规矩的，可朱由检居然推翻了这一切，明确要求司礼监太监参与到朝会之中。
朝臣的反对没有作用，朱由检最终拍板，做出决定，要求司礼监太监参与朝会并针对朝政提出意见建议，朱由检甚至还准备为司礼监太监参与朝会下发圣旨，将这件事情完全明确下来，今后都照此执行，被司礼监大太监王承恩劝阻了。
激烈的争