“不行，我不能看着他这样胡搞，除非他罢了我的官！”冷静下来的陈炯明下了决心。
三天后开始，陈炯明代表广东省政府陆续颁布“暂行县自治条例”，“暂行县长选举条例”和“暂行县议会议员选举条例”。条例规定，县级政府具有地方部分事务的决策权，而条例未规定者归省政府管理。
县议会议员有任期限期，县政府受省政府监督，民选县长由县民直接选举县长侯选人三名，再由省长择一委任，这是为了避免部分地方恶势力干扰选举。
舞弊违法的问题则交由省法院处理。陈炯明将地方法院分为数级，分别为地方审检厅、一等地方法庭、二等地方法庭、三等地方法庭。同时他严禁自己的部队未经司令部允许将犯人就地枪决。
再接下来就是发表通告，在广东禁赌禁烟禁娼。并在广州东校场公开销毁了价值四十万元的十四万两鸦片烟。
半个月后，聘请前来主持教育工作的陈独秀到达广州。陈炯明认为，如今的教育已经不是单单认几个字，背几篇古文了。而是工科，理科、农科并重。随即发布《振兴教育令》，把改良县教育行政和学校教育，积极办理义务教育、社会教育和职业教育，列为当务之急。执行“一乡一校”计划，在农村普遍设立现代学校。陈炯明不惜经费，宣布禁绝私塾，改而设立从师范学校、普通中学到工读学校、平民夜校、妇女家政讲习所在内的门类齐全的学校。并筹建岭南农学院。
然而，陈炯明说做的这一切，并不能改变孙文既定的计划。相反，让孙文和陈炯明之间的分歧更大了。最根本的分歧就是陈炯明搞的‘联省自治’的这些动作，妨碍了孙文成立国民政府，选他当大总统的计划。
1921年元月，非常国会在广州复会。孙文号召国民党人，像推翻清政府、袁世凯那样，再发动一次全国性的革命，来推翻北洋政府，他宣称：“北京政府实在不是民国政府。我等要造成真正民国。”
对此陈炯明非常不以为然。依‘临时约法’总统由两院联席选出，出席议员至少须全部的三分之二，即580人才能举行选举总统会，现在广州的旧国会议员才两百多人，还不够原众议院人数的一半，而且实行记名投票，这岂不是自毁法律吗？和北方废除‘临时约法’又有什么本质不同？一旦广东成立正式政府，南北之间将再次陷入战争之中。只是他的反对并没有起到任何作用。
二月，在二百二十二名议员的选举下，孙文以二百一十八票当选‘非常大总统’。同时还表决通过了民国政府组织大纲，在这个文件中，只规定了大总统的产生和权限，却没有任期，也没有规定政府的组织架构。一切政务、军务、内阁任免，均由大总统“乾纲独断”。在满清皇朝被推翻十年后，一个新的皇帝诞生了，只是把皇帝的名号换成了‘非常大总统’。
当然，孙文考虑到舆论，在就职时留了个说辞：北京政府如果恢复‘临时约法’，恢复国会，徐世昌辞去总统职务，由黎元洪当回总统的话，他是会辞去这个临时大总统的。在他看来，北洋政府是不可能再恢复‘临时约法’，也不可能再让黎元洪当回总统的。只是，他没想到，不久之后。他就被他的这个承偌搞得名声扫地。