济宁王王薄迫于无奈，决定献城投降，李逍遥大军在半路上就见到了王薄派遣而来的使者，直接将投降书交予李逍遥。于是，李逍遥接受了王薄的投降，大军畅行无阻地达到济宁，直接将山东济宁收复了。济宁王王薄出城迎接李逍遥的大军，并且接受李唐的官职，成为齐州总管。
王薄归顺于李唐，为了向李渊表示自己的忠心，决定亲自出面前往青、莱、密等州，劝说他们投降唐朝。李逍遥得知王薄迫切地表现自己，微微一笑，也就从济宁将大军撤出了。王薄在劝说他人投降这件事上立了功。
于是，李渊就派遣他跟随唐朝宋州总管盛彦师率军攻打须昌，向潭州征调军粮；潭州刺史李义满因与王薄有矛盾，关闭粮仓不给军粮。待须昌投降，盛彦师逮捕李义满，将他关入齐州监狱，唐高祖下诏命令释放李义满，只不过长安城距离齐州较远，朝中下达诏令的使者还没到齐州，李义满不堪受辱，忍受百姓的嘲弄，在狱中自杀身亡。
王薄班师回朝师，经过潭州，李义满的侄子李武意认为是王薄害死了自己的伯父，就派兵深夜偷袭捉住王薄并将他杀害。唐高祖李渊听闻王薄被杀，脸面尽失，大怒之下派遣大军围剿李武意，李逍遥闻之微微一愣，他无奈地叹息一声：“生死有命富贵在天！”
与此同时，整个华夏大地都在蔓延着战争。唐高祖李渊任命李逍遥为天下兵马大元帅，以一国之力与众多反王对抗，将数十万大军全部拆分，想要一举歼灭华夏大地的反王势力，将群雄割据的时代结束，迎来只有一个大唐王朝的时代。于是，李逍遥命令大军全部出发，兵分多路进攻反王势力，掀开全面大战的局面。
杜伏威带领三万大军前去河北剿灭凤鸣王李子通；秦王李世民在李玄霸的跟随下，亲自率领三万兵马前去讨伐南阳王朱灿、曹州宋义王孟海公；李靖、徐懋功两人为将率领五万大军抵御突厥大军的侵袭；秦琼、程咬金、罗士信三人率领四万余人攻打相州白御王高谈圣、兖州鲁王徐圆朗等人。
其中，凤鸣王李子通占据着海陵自封为楚王，他率领大军渡过长江攻打沈法兴，夺取京口。沈法兴派遣他的仆射蒋元超抵抗李子通，双方在庱亭交战，蒋元超兵败身亡，沈法兴放弃毗陵，逃奔吴郡。于是，晋陵、丹阳、毗陵等郡都投降了李子通；李子通任命原沈法兴的府掾李百药为内史侍郎、国子祭酒，主掌文书，尚书左丞殷芊为太常卿，主掌礼乐，由此江南士人纷纷前来归附于李子通。
杜伏威占据着历阳，后来归顺于李唐，李逍遥毫不介意他刚刚归顺，不怀疑他的忠心，直接任命他为剿灭凤鸣王李子通的大将，使得杜伏威对李逍遥唯命是从，忠心耿耿的为大唐王朝尽心尽力。杜伏威派行台左仆射辅公祏率领数千名士卒攻打李子通，任命将军阚棱、王雄诞为辅公祏的副将。
辅公祏渡过长江攻打丹阳，攻克丹阳后进军驻扎在溧水，李子通率领数万兵马拒敌。辅公祏挑选了一千名精兵手持长刀作为前锋，又命一千人跟随在后，他扫视了众人，对这一千人斩钉截铁地说道：“有退却的，立即斩首。”
既然辅公祏是副将，他说出的话，自己要承担起相应的责任来，他身先士卒，亲自带领剩余的兵马，又在这一千人的后面。李子通列方阵前进，辅公祏的前锋部队殊死战斗，辅公祏又以左右翼攻击李子通的方阵，李子通兵败逃跑，辅公祏追逐反而被李子通所败，返回军营，坚壁不出战。
战局难明，恰巧此时王雄诞向辅公祏劝谏道；“李子通没有营寨壁垒，又满足于小胜，我们乘他不加防备袭击，可以打败他。”辅公祏自认为王雄诞纸上谈兵，而且自己刚刚被李子通击败，认为士气大减，此时不应出兵为由不予听从。王雄诞愤怒至极，认为辅公祏小瞧自己，于是他便带领自己的几百名士兵在夜晚袭击李子通，乘风势放火，李子通大败，数千士卒投降王雄诞。李子通粮草食尽，于是放弃了江都，保守京口，于是江西地区全部归属杜伏威所有。
不久，李子通又向东逃往太湖，收拾散兵，得到二万人，在吴郡袭击沈法兴，大败沈法兴。沈法兴带几百个亲随放弃吴郡城逃走。李子通的兵力重新强盛起来，便将都城迁到余杭，接收了沈法兴的全部地盘，东到会稽，南至五岭，西抵宣城，北达太湖，全为其所有。
武德五年，即公元622年七月初八，杜伏威派遣部将王雄诞攻打李子通，双方大战于苏州，李子通被击退，便率领精兵防守独松岭，王雄诞派其部将陈当率兵一千人出其不意，乘高据险，视线的错觉，虚张声势，白天命士兵一人举着两张旗帜，夜里命人在树干上缚扎炬火，遍布于整个山泽之间。
李子通不明所以，以为李唐援军抵达了，甚是恐惧，决定烧营而逃，退保余杭，王雄诞进军包围余杭城。走投无路之下，李子通力逼得不已，派遣使者向杜伏威请求投降，杜伏威接受了他的投降，将他和左仆射乐伯通一起押送长安。
唐高祖李渊不但未治李子通的罪，还赐予宅第一所、田地五顷，赏赐钱物颇多。杜伏威率领大军击败了凤鸣王李子通，被李渊下诏入朝，留在长安，任命为太子太保，仍兼任行台尚书令。只不过李子通心中愤愤不平，心里非常的不甘