马尼拉分为内城和外城，内城就是之前的西班牙王城，里面只有一些西班牙人留下来的民房，还有两座大教堂，这个时候里面的居民正好全部撤走了，于是这里面便彻底成为了中华军的军城，按照项玉的打算，他打算将这座内城里面的空间利用起来，在里面修建马尼拉的军工厂，以生产提供给吕宋的中华军的武器装备，吕宋岛的人口数量相比于台湾来说更具优势，并且马来岛上面也有很多华人，甚至在一百多年之后建立了一个兰芳国出来了，这说明印尼群岛上面的华人的人数和规模相对于吕宋上面，更多一些，中华军在吕宋站稳脚跟之后，可以先吸纳这些华人前来投奔，待到实力达到一定的程度之后也可以染指这些地盘。
不过这些事情项玉是不打算自己亲自操办了，最近清廷内部传来消息，据说中华军攻打琉球的事情已经传到大陆去了，加上之前冯信的求援使者的活动，使得清廷内部对于孤悬海外的这一股明朝的“余孽”起了戒心，满人虽然以骑射起家，对海战不是很熟悉，但是这个时候早期投降的一些汉人大臣如洪承畴、范文程等人都建议重用汉人将领，其中被他们举荐的就是被掉到京城的福建大将施琅。
施琅此时已经在京闲赋了接近两年的时间，起初他过得战战兢兢，害怕满人会对他像之前对待郑芝龙一家一样直接杀掉以除后患，因此整日待在府中不敢外出，后来满清高层陷入了皇帝驾崩之后的权力争夺的漩涡之中，对他的防备和监视也不像之前那么严厉了，这才使得施琅能够稍稍的活动一下。
明末时期东南沿海一带的大海盗集团层出不穷，这一局面在倭寇之患的时候就已经十分严重了，所谓倭人之患，其实说白了就是当地的大海商勾结一批日本流浪士兵和武士所带来的海患，其中沿海一带的商人利用自己的对地形和官场的情报，花钱雇养一批海盗，其中主要还是中国人，少部分是日本武士，他们盘踞在沿海一带的海岛上面，利用商人的眼线提供的情报对沿海一带进行劫掠，这曾经一度对广东浙江福建一带造成了十分严重的影响。
后来虽然倭寇之患被齐吉冠所平息，但是海盗集团的势力却越来越强，起于万历年间的诸彩老、李魁奇、杨六杨七等人，后来的刘香、郑芝龙等人都是大海盗集团起家，其中郑芝龙势力因为善于打点长袖善舞，最后被朝廷招安，得到福建水师的支持之后船队势力和舰船武备大增，相继击败了诸彩老、李魁奇、刘香等人，甚至还击败了荷兰人和海盗联合舰队，这便是料罗湾海战了。
而施琅当时便已经跟随了郑芝龙，算是他的手下的一名小头目，海盗起家的时候大多相当于后世的入股，小股船队汇聚成一大股海盗，因此像施琅这样的小海盗，经年累月下来手里面也拥有一笔不小的财富，更何况后来郑芝龙几乎垄断了东南沿海一带的对外贸易，就连英国的船队都要向郑家水军交纳保护费，所以底下的人也都小发了一笔。
施琅这个时候拿出多年的存财四处走动，想要疏通一下，他明白一个道理，那就是上面有人好办事。