主线文的简介：
在数码世界一千年以前，以黑暗系数码兽为首领的病毒种们为了统治数码世界，向整个数码世界发动了侵略战争。而三大天使们为了守护数码世界不得不抵抗敌人。
代表不同阵营的七大魔王也突然出现。由于七大魔王的实力太过于强大，天使型数码兽们开始节节败退。
由于战争过于激烈，数码世界的平衡也受到影响，伊古多拉希尔就派遣皇家骑士们帮助三大天使。
因为战争太过于惨烈，在牺牲了数名皇家骑士的情况下好不容易将七大魔王打败并被封印，三大天使也只剩下神圣天女兽活下来。
一千年之后，数码兽开始大量增加，被终端电脑世界树管理着的世界因为不断膨胀的数据量而面临崩溃的危机。
而在人类世界，十年前，世界各地也开始出现异常，莫名的有人类失踪，甚至有人亲眼看到怪兽。同时，莱德的父母通过调查可以肯定人类世界的次元出现扭曲，有另一个不为所知的世界和人类世界有着关联。在多日的研究下，莱德父母发明了通往异世界的次元之门，可是在一次实验中，7岁的莱德在观看父母的实验中，次元门突然发生故障，莱德被吸入了异世界。为了找回自己的孩子，便因此建立了数码世界探险队，其中也包括凯伊和亚北的父亲......
探险队的成员回来之后，莱德的父母经过政府的同意，与朋友一起建立了d，狩猎数码兽的秘密组织，将误入人类世界的数码兽狩猎，将数码蛋送回数码世界
然而，随着数码兽的陆续增多，主角们开始察觉出有人刻意让数码兽去人类世界故意袭击他们
直到妖狐兽的出现，才说出数码世界面临毁灭的命运，而袭击凯伊等人的数码兽们也是吸血魔兽的部下，并从中得知吸血魔兽似乎打算入侵人类世界。
经过一系列让人悲伤的事件后，凯伊等人打算去数码世界完成使命，并得知事件的真相。
真相并非是他们所想象的那么简单，那么他们所经历的究竟是......