就当武田信玄派遣马场信房、保科正俊、藤泽赖亲等信浓诸将率军五千余进驻古厩城、岩原城等地做好随时翻越燕之岳、立山连峰侵攻东越中的准备之时，武田家一门亲族重臣小山田信茂已经对武田信玄屡次征收繁重的赋税以及不停的军役产生失望。小山田信茂凭借着自己领地与上杉领接壤的便利，暗中派遣家中重臣小林宫内助和一门众小山田八左卫门（小山田信茂从兄弟）前往河越城与上杉家取得联系。由于朝定不在河越城中，担任留守役的山崎秀仙不敢擅作主张，便将小山田信茂所写的书信送至越后府中，由谦信再转交给朝定。
朝定鉴于胜沼信元、今井信良两名内应因多次与自己展开联系被武田信玄发现并且拔除，便不打算与小山田信茂展开过多的接触，仅仅只是搭上线，除非在万不得已的情况下联系。
同时，身在东越中鱼津城的朝定令重臣广泽忠信、曾我佑重、宫城政业、大森藤赖、大森实赖等人对上州兵进行改编。由于上州兵屡次对外作战已经从当时的八千余人的规模降至六千不到，故而朝定决定在眼下尚未发生战事的这段时间里将上州兵进行改编和补员。
朝定对选拔淘汰的标准送至广泽忠信、曾我佑重、宫城政业、大森藤赖、大森实赖等人的面前后，众人全都目瞪口呆，他们根本没有想到朝定的要求竟然会如此严格——士卒皆披胴丸，手持长枪，配带打刀肋差，身背四方竹弓（由四片竹包裹著木芯的合成弓），负矢囊内装弓箭50枝，携带三日口粮，半天能走七里（1里=3927.2米，约等于4000米）接战。
好在上杉领内人口众多、土地肥沃、物产丰富，纵横、交通便利所以天下物产云集从而使商业繁荣、制作业发达。朝定对上州兵所提出的标准也并不难达成。广泽忠信、曾我佑重、宫城政业、大森藤赖、大森实赖等人随后在两个月内便将六千上州兵筛选至三千人，而后又在上野、下野、武藏、上总、下总、岩代、磐城、陆前等地招募士卒。广泽忠信、曾我佑重、宫城政业、大森藤赖、大森实赖等人优先招募当地地头武士、豪族、领主的庶子、次子等不能继承家业的男子，而后再对领民进行招募。
八月三十一日，原江户家一门重臣的枝川通清、枝川通近、枝川兵库介、鳄渊通资、鳄渊通忠、鳄渊通宪等江户家、佐竹家旧臣们在连续与上杉军的作战中失利后只好退守饭沼城，并且坚持不降。而太田资正则认为这是一个彻底攻灭江户氏残党千载难逢的机会，随即派遣麾下战力较强的鸿巢七骑（鸿巢众，大岛、小池、河野、立川、深井、本木、矢部）率军三千余火速进入东常陆与岩付太田家重臣三户景道、本间小五郎、潮田资胜、北泽直信等人合流，并且对东常陆一揆众仅剩下的饭沼城进行猛攻。
枝川通清、枝川通近、枝川兵库介、鳄渊通资、鳄渊通忠、鳄渊通宪等人在饭沼城内笼城死守了半个月后，城內粮尽力屈，城池也随后被上杉军所攻落。枝川通清、枝川通近、枝川兵库介、鳄渊通资、鳄渊通忠、鳄渊通宪等掀起东常陆国人一揆的首要人物被上杉军讨死后首级送往河越城，其城兵、党羽、家眷等一千余人全部被太田军诛杀，历时五个月的东常陆之乱就此平定下来。常陆江户氏至此彻底灭亡了，从此以后，在常陆国的土地上，再也没有出现过佐竹氏、江户氏一族对上杉家的反抗了。
朝定自从率军三千余在进入鱼津城后并不急着召开军役研究对东越中国人一揆的战术和战略，而是迅速派遣使者前往七尾城请能登守护宇佐美定满率能登诸将前来助阵。
得知朝定进入越中的神保长国、寺岛职定、柴田久光等东越中一揆众随即停止了对外扩张的势头，立即做好了在稻村城、上市馆、寺田城、日中城、新庄城等地的笼城准备。
然而，神保长国、寺岛职定、柴田久光、神保茂政等东越中一揆众见朝定迟迟不从鱼津城出阵后便认为他是在顾忌驻守在古厩城、岩原城等地的五千余武田军，随后神保长国便令神保出羽守、神保长利、神保茂政等一门亲族众迅速率军五百余将原越中守护代神保家的本据富山城袭取，同时还在富山城的西面和南面新筑大峪城和掛尾城用于牵制西越中和能登方面的上杉军。
朝定得知富山城被神保长国、寺岛职定等东越中一揆众袭取后认为不能再让一揆众继续在越中一国肆意妄为了，在与宇佐美定满、神保觉广、小岛职镇、长景连、唐人亲广、畠山将监等能登诸将合流之后，朝定一共集结了二万余大军，再一次踏上了平定越中的旅程，不到两天便攻破了神保长国为阻拦上杉军进军而设置的大峪城和掛尾城两座支城，并且取得了斩首三百多级的战绩，进而兵锋直指东越中一揆众的新本据——富山城。
神保长国得知自己才下令新筑的大峪城和掛尾城两座支城被上杉军在两天内攻落的消息后吓得魂飞魄散，自知没有与上杉军匹敌的实力便不敢继续在富山城笼城死守，随后急忙率城兵弃城而逃，遁至其原先举兵的本据稻村城。
九月十日，朝定在夺取空无一人的富山城之后便马不停蹄的向新庄城、寺田城、上市馆等东越中一揆众所占据的城池兵砦展开猛攻，于当天将东越中一揆众所占据的五座城池兵砦全部攻落，之后又一并攻陷受武田信玄调略而举兵反叛的舟