这之后，儒生们的话语渐渐放肆，一些儒生竟然背后议论秦始皇，秦始皇越来越恼火，终于发生“焚书坑儒”事件。消息灵通的，悟性高些的，在秦始皇动手之前隐匿逃出。浮丘伯也离开咸阳到了曲阜，曲阜是儒学的故乡，各地学子纷纷前往求学。浮丘伯收了许多弟子，其中知名者有穆生、白生、申培，还有来自沛县（今属江苏）的刘交，即西汉开国皇帝刘邦的弟弟。秦朝颁布焚书令，烧毁《诗》、《书》，严禁私学，浮丘伯师徒被迫辍业，刘交返回故里，不久即参加了刘邦的反秦队伍。刘邦战胜项羽，举兵围鲁（即曲阜），浮丘伯等鲁中诸儒还在讲习礼乐，弦歌之声不绝，以致刘邦大为感叹，不忍再动干戈，对鲁采取招降。后来鲁地归汉。刘邦再次路过曲阜，浮丘伯曾率弟子前往鲁之南宫拜见刘邦。
西汉建立后，刘交被封为楚王，延请同学穆生、白生、申培等到楚做官，浮丘伯居住曲阜12年后则迁居西汉首都长安（今陕西西安）继续从事讲学事业。应该说新的帝国王朝让浮丘伯重新燃起建功立业的希望。他把儒家经典在授学中重新阐述了一番。楚元王刘交特别喜欢浮丘伯讲习的《诗》，曾亲自为《诗》作传，号称《元王诗》，并要求几个儿子一律读《诗》。为了使自己的后人得到先师荀子的真传，吕太后时，他特派申培伴随自己的儿子郢客前往长安，直接向浮丘伯求学。汉代儒学中的“鲁学”学派，就是浮丘伯弟子所兴起的一个学派，从而开创汉代新儒学，至汉武帝时形成影响整个封建社会的“独尊儒术”的局面。