而沙俄政府在雅克萨失败以后，并不甘心，就在《尼布楚条约》签订的第二年——康熙二十九年，又去唆使准噶尔部的首领噶尔丹。本来就野心勃勃的噶尔丹再次蠢蠢欲动。自从他统治准噶尔部以后，最先兼并了漠西蒙古的其他部落，现在再次向东进攻漠北蒙古。漠北蒙古抵抗一时失败了，几十万的漠北蒙古人逃到漠南，请求清朝政府保护。
康熙二十九年七月，当噶尔丹又入犯乌珠穆沁发动叛乱时，接到邸报的康熙认为噶尔丹气势汹汹，野心不小，既然打进来，非反击不可。这给点儿颜色就想开染房的小子还真是活腻歪了，便金口一张，大笔一挥，宣称“朕要亲征噶尔丹”。