马里纳亚海沟北部，在人类鲜少涉足的深渊之底，埋葬着许许多多巨大的石碑。石碑上用古老的文字记叙着一个遗失了数百年的古老文明。
海妖一族原本的名字并非海妖，而是鲛人。在人类的历史记载开始之前，他们就已经存在了。漫长的岁月里，当天空中的羽民逐渐绝迹，当人类成为了这个星球的主人，开始书写自己漫长的历史，鲛人逐渐切断了与陆地的联系，隐居在大洋深处。只在很偶尔的情况下被人类看到。
不同于人类逐渐摒弃了宗教信仰，鲛人始终认为神明和轮回是真实存在的。鲛人相信世界是被大荒神创造。在创世完成后，大荒神留下了十二神识，在世界有危难时降世拯救世人。不过这十二个神识早在人类记载的历史开始前就已经完成了各自的天命，消失在轮回之中了。
鲛人的主神乃是海神应龙。这位神明不仅仅存在于传说中，而是真真切切以鲛人的身份生活在他的子民之间，协助历任海王守护海中的万物。他有着不断转生的能力，在他每一世临终前会给鲛人的宗教领袖大侍僧留下自己未来转世的时间地点和特征，而大侍僧则会一直保存着这神圣的信息，直到预言中的时间到来，迎回新一世的应龙。这传统延续了数千年，直到五百年前，应龙将所有鲛人侍僧召集起来，告诉他们：
大荒（地球）的寿数所剩无几，许多物种都在大规模灭绝，海洋的生存环境也在每况愈下。海水越来越暖，有毒物含量越来越高，鱼群和植物大面积死亡，大规模的疫病数次在鲛人各大主城中蔓延，生育率也逐年降低，甚至一年中只有寥寥几只幼年鲛人出世。种种征兆，预示着大荒秩序已经被打乱了。在轮回中转世的魂灵找不到可以投胎的*，在轮回盘中越聚越多，另秩序逐渐崩塌，而神界与大荒的通路也即将彻底关闭。在未来一千年内，这个星球就会变成一片荒泽焦土。
他作为唯一留在大荒的神明对于即将到来的末日无能为力，能解救世间的唯有大荒神神识。但是由于神识已经散佚在轮回中，无法轻易找到，唯一的办法，是他离开大荒，回到无上神界，召唤神识降世。只是他这一去，很有可能就无法再回来了，直到秩序重新建立，神界与大荒的通路打开。
海神应龙在交代完这一番话后，便双目闭合，入了涅槃。鲛人们在没有神明的黑暗世纪中踽踽独行一百年，终于等到了应龙所说的神识——宸渊降世。
然而神识的降生并未能够马上扭转逐渐没落的鲛人命运。人类将污水、核废料、石油、重金属等等一切毒物排入海中，海藻和鱼类大面积灭绝，新的疫病一次又一次肆虐在锐减的鲛人之间。同时由于陆地上的自愿日趋匮乏，人类开始开发海下资源，鲛人们时刻面临着被发现的危险。
当无数的母亲或父亲抱着自己全身溃烂的孩子放声痛哭，继而选择放弃生命；当成千上万的鲛人为了不被人类发现被迫离开世代居住的海域四处流浪；当因为捕食不到鱼类也无法种植海藻而陷入饥荒，鲛人之中开始出现了憎恨人类的极端分子。他们会在人类的船只附近制造风暴、将跌落海中的人类拉入深海中溺亡、利用声波干扰船只的雷达另它们触礁。
宸渊明令禁止私自攻击人类的行为，因为他知道，这样下去鲛人的所在一定会暴露。但是极端分子的数量越来越多，民间不满的声音越来越大，甚至动摇了大荒神的信仰。鲛人们开始怀疑了，怀疑那个不过一百岁的年轻鲛人是否真的是海神祈求来的救世主，怀疑是否神明们已经彻底放弃了这个世界。他们高喊着要为了死去的族人、为了死去的海洋，为了死去的大荒复仇。他们相信，只有毁灭人类，才能够真正拯救这日渐崩溃的世界。
仇恨的情绪在仅存的鲛人城市间蔓延，被浓重的寂静笼罩的海国陷在山雨欲来的不安之中。终于，反叛的鲛人组成了军队，袭击了纽约和东京，他们自称代表所有鲛人，是宸渊的部下。
人类不会知道鲛人内部的斗争，人类只会认为，这是整个海妖族在向人类宣战。在那些仇恨人类的鲛人将人类的注意力引入深海后，宸渊被迫向人类宣战。
当人类向鲛人发出和谈请求后，宸渊一度考虑此提议。但是当时鲛人首战告捷，仇视人类的呼声已经到了前所未有的地步。更可怕的是，鲛人们从人类俘虏口中得知，人类正在秘密研发对付鲛人的武器。
纵观整个人类的历史，不论理由是什么，战争从未间断过。这是一个勤奋努力、但也残忍短视的种族，宸渊知道人类的和平承诺从来都只是一纸空谈。在这个失去信仰的年代，只要是利益驱使，没有什么事人是做不出来的。如今鲛人的存在已经暴露，盲目相信人类的承诺，只会将仅剩的族人送向灭亡。
终于，他决定拒绝和谈。
那个时候的宸渊还没有得到大荒神的大部分记忆，体内的神力也还没有完全觉醒。所以他忘记了作为神识的他，要保护的不仅仅是鲛人而已。而他和鲛人一族也为此付出了惨痛的代价。
接下来发生的一切一如人类历史的记载。宸渊被俘，鲛人战败，几乎被灭绝。仅存的鲛人被奴役三百年，鲛人文明几乎毁灭殆尽，甚至就连“鲛人”这个名字也被抹杀了，只剩下那些残碑上的只言片语。
三百年后，一小拨逃离了人类奴役的海妖在马里亚纳海