最后才是海军的编制，现在海军将划分为两支大舰队，北海舰队与南海舰队，防区划分是以长江出海口为界，长江出海口以北的区域属北海舰队防御，司令部设在青岛，而防备的主要对像是日本，这是由于现在俄国在远东地区的出海口都己被人民军占领，因此俄国海军基本不足为虑，而日本海军虽然在远东战争中受创严重，元气大伤，但以日本人的性格，是肯定会重振旗鼓，卷土重来的，加上华东**还要收复台湾，并将日本从朝鲜半岛上逐离，双方基本不可避免的还要再打一次。
北海舰队又下设有三支舰队，分别是远东支队、渤海支队、黄海支队。远东舰队的司令部设在海参崴，防区是海参崴以北；渤海舰队的司令部设在旅顺，防区是整个渤海地区，一直到烟台，主要的任务就是拱卫京师；黄海舰队是北海舰队的主力，也是钳制日本的最主要力量，司令部设在青岛，防区是山东半岛至长江出海口以北的地区。
而长江出海口以南，包括刚刚获得的婆罗洲，都是属于南海舰队防区，司令部设在上海，这个防区的主要对手是英法美三国驻扎在远东的舰队，虽然英法两国的舰队在远东战争中遭到重创，而且两国的主要目标在欧洲，但远东地区毕竟是两国重要的殖民地，而且两国毕竟实力雄厚，远东战争的失利并未让两国伤筋动骨，因此肯定会在远东地区重新组建一支规模相当的舰队。美国虽然和华东**的关系尚好，而且军事力量也不算强，但毕竟国力雄厚，由其是在华东**得到婆罗洲以后，对美国在亚洲的殖民地菲律宾形成了夹击之势，美国也势必会加强在菲律宾的兵力。
南海舰队下设二支舰队，分别是东海支队、婆罗洲支队。东海舰队的司令部设在上海，主要的任务就是保卫上海的沿海地区，虽然现在上海是华东**孤悬的一块飞地，但却是华东**最要的城市之一，从某种程度上说，上海的重要性甚致可以超过青岛，因此自然是要重点守卫；而婆罗洲舰队的司令部自然是设在婆罗洲上，但俱体在那里还是还没有确定好，毕竞现在婆罗洲还没有怎么开发，以后将根据旧时空的资料以及这个时代的实际水文情况选择一个适合的位置，任务自然是保卫婆罗洲及其海域，这里是华东**在东南亚地区扩展的重要支点，当然也是不能忽视的。
而在这个五年周期内，华东**正式建国之后，这个海军编制也是可以适用的，毕竟华东**建国，主要的领土变化是发生在北方地区，而华东**现在所控制的海域基本不会发生变化。只有在华东**统一中国之后，南海舰队司令部将会迁移到广州。而海军编制真正的大变化，是在收复台湾及琉求群岛之后，届时将会在成一支太平洋舰队，令海军面对太平洋方向。