曾纪泽指挥着三艘军舰排成“一”字队形无一损伤地进入了马尼拉海湾，黎明时，大汉国舰队逼近马尼拉，开始搜寻西班牙舰队。城里的炮兵猛烈开火，可惜大炮的射程不够远，炮弹全都炸在了海湾里，激起滔天的浪花。
蒙托尔特为了使马尼拉城免受炮击，果然就把他的舰队部署在城外，曾纪泽在这儿找到了它们。
为了节省弹药，提高命中率，曾纪泽一直逼近到离西班牙舰队只有3ooo码的距离，才下令对着蒙托尔特乘坐的“克里斯蒂娜”号开火。
三艘大军舰在西班牙军舰前往复航行，不断地进行射击，“克里斯蒂娜”号和三艘西班牙军舰几次企图冲击中“龙腾”舰，均遭重创。一个小时的炮击，蒙托尔特带领的七艘军舰不是冒起浓烟，就是葬身海底，或是被弃了，“克里斯蒂娜”号在激烈的海战中，驾驶舱被“龙腾号”的炮火击中，西班牙舰队就全军覆灭，蒙托尔特本人也被炮火击中而死！
当曾纪泽下令停火时，西班牙军队在这场战斗中，伤亡581人，而中国舰队，只有5人受轻伤，黑旗军舰队朝西班牙舰队开火，至少命中了17o炮弹，而缺乏射击实践的西班牙水兵，仅仅命中了15。
西班牙海军丧失殆尽，于是，曾纪泽就命令刘永福的舰队在马尼拉附近海面抛锚，防止外来军舰的干扰。这时，5艘荷兰军舰现身。原来，荷兰人一直在寻找机会，一旦黑旗军舰队在菲律宾战败，他们就准备马上把菲律宾掠为自己的殖民地。遗憾的是，黑旗军舰队在菲律宾大胜，毫无损。刘永福率领黑旗军舰队迅上去拦截，荷兰舰队一看黑旗军舰队毫无损，就当自己是路过了，逃之夭夭。
黑旗军舰队在赶走荷兰舰队的路上，还兵不血刃就占领了西班牙所属的关岛，岛上的总督竟然不知道已经大汉国和西班牙已经爆了战争，这时，大汉国也并未正式向西班牙宣战。他们根本不知道有大汉国，还以为是中国跟西班牙开战了。
随后，在黑旗军舰队强大的火力支援下，八千黑旗军在马尼拉湾登6。在短暂的炮击之后，西班牙岸上的一万多无心再战的守军投降，中队遂进攻马尼拉城。
城内马尼拉的华人和几千土著起义军，见华人武装开始攻城，也开始暴动！在他们和大汉国的6、海军的联合攻击下，马尼拉城里的西班牙军队群龙无，还遭到内外夹击，刚开始还很拼命抵抗，后来，夏天岛上的天气湿热，很多西班牙士兵患上了热疫，大汉军舰队封锁了菲律宾附近的海域，不允许任何商船进入，缺医少药的西班牙6军又苦无外援，竟然象征性的抵抗一下之后，就宣布停火，向大汉国投降。
这时，菲律宾王室的“苏丹”派人送信给刘永福，要求菲律宾自立，恢复王位。刘永福一听，火大了，训斥使者：“妈的个巴子，老子带领黑旗军兄弟出生入死，浴血奋战，辛辛苦苦赶走西班牙人，你一个十二三的小毛孩自立个屁呀”，随即，刘永福解除苏丹土著的武装，把菲律宾的土著和王室赶到了深山老林中，要求菲律宾独立的分裂分子，被刘永福屠杀了上千人，从此他在菲律宾得了一个“刘屠夫”的外号，菲律宾的小孩，听到刘永福的大名，都吓得哭不出来！
曾纪泽随即宣布在菲律宾群岛设置总督府，由移民到当地的华人组建政府，又6续从江浙和两广，还有婆罗洲，移民百万人，华人位为菲律宾第一等人，享受法律特权。为了开菲律宾，曾纪泽还在菲律宾设立龙兴公司，享受税收特权，专门出口菲律宾矿产，还有菲律宾女人。菲佣被运到欧洲和美利坚当女仆，这些菲佣价格便宜，深受世界各地的欢迎，为大汉国赚取了大量外汇，这些钱都被曾纪泽投到大汉国的经济建设中！