郑芝龙积极备战之时，琼州营的运输船队正在舰队的掩护下沿着厦门岛西南海岸航行，直逼中左所城。按照战前的推演，郑芝龙如果没死，必定会逃到所城固守，所以陆军直接攻打这里就是，而不是从码头登陆，一路推过去，太耗费时间和精力。
中左所城在厦门岛的西南海岸，背靠五老山，与鼓浪屿隔海相望，大致是现在厦门大学的所在地。在所城的东面正是著名的胡里山炮台。因为此地扼守着鼓浪屿和厦门岛之间的水道要害，号称“八闽门户、天南锁钥”。位置十分重要，因而郑芝龙在这里架设了几门从葡萄牙人手里买来的舰载24磅加农炮。
按照当时的水平来看，这座胡里山炮台的设防已经不算简陋，尽管炮不过三四门，台兵不足百人，但都是大口径的精良火炮，也没有空饷凑数，比起破破烂烂的广东虎门亚娘鞋炮台要精干得多。郑芝龙相比广东的官僚来说在海防上更有见识，所以在中左所的防御上还是颇下了些本钱的。
威廉以舰队指挥官的敏感判断出了这座炮台的威胁——虽然这些加农炮难以威胁到海上航行的战舰，但是毕竟是一个麻烦。特别火炮的射程能够到到陆军预计登陆的海滩，所以，必须在发动登陆战斗前摧毁这一炮台。
混合舰队驶过怀信石，随后停泊在海面上，在一里多的距离锁定了目标。
普通的实心弹很难在这个距离对石头垒成的炮台造成致命的伤害，于是威廉直接下令用轰击炮。
第一轮炮击用的实心弹，用来判断落点，修正角度。几枚实心弹稀稀疏疏落在了炮台周围，崩掉了炮台的一角，碎石四处飞溅。炮台的守军手忙脚乱进行反击，24磅炮开火了，只是准头太差，大多落入海中，溅起了高高的浪花。
找准落点后，两艘永乐级的轰击炮换上了爆炸弹。“轰轰轰”，左侧四门炮一齐开火，四枚硕大的爆炸弹准确无误地落在了炮台里，紧接着发出更为巨大的响声，爆炸产生的气浪把沉重的24磅炮连同炮手的尸体都抛到了半空，碎石乱溅，整个炮台直接塌陷。
摧毁胡里山炮台之后，位于海边的中左所城就已经毫无掩护了。可以任意行动。运输船队安全驶过胡里山炮台，随后各船下船锚，夏天南亲自下令：“开始登陆！”
登陆地点选在胡里山炮台前的沙滩上，此地距离中左所城还有大约二公里。一艘接一艘的广船放下预先备好的多艘舢板，在甲板下闷了许久的陆军士兵开始陆续登上舢板，往沙滩划去。负责清点人数和协调登陆事宜的军官们不停的催促“快快快！”登陆作战不比海战，目标又是千户所城，政治风险大得多，必须速战速决。
琼州营开始登陆的同时，所城衙署内，郑芝龙正在进行最后的动员：“传令粮台，送三十万两到门楼这边摆开，我要大赏三军！出城迎战的兄弟，每人赏十两，守城的每人五两！只要打退琼州营，每人再赏五十两！战死的除了抚恤，一样也得赏！”
众人一阵骚动，这不是重赏，简直就是匪夷所思了。正常情况下，打了胜仗不过赏四五两，要有战功或者“带花”，才能赏到十两以上，这在明末的各种武装力量中已经是极其优厚的了，更别说叫花子一样的官兵了。现在只要出城迎战就有十两，得胜后还有五十两，这赏格未免太惊人了。
郑彩不由得站出来劝谏：“这，大哥……是不是太重了……这个口子一开，以后若无这般重赏，军士们便不肯出力打仗了……”
“现在正是要大伙卖命的时候，几十两银子买条命值不值？我看很值！”郑芝龙说，“若是我们陆战再打败仗，连所城也丢了，我们就一无所有了，哪还有以后！”
郑芝龙很清楚眼下的形势，这一战再败，郑家就彻底倒下了。与其这样窝囊的战败，把满城财宝货物白白的送给琼州营，不如散出来收买人心，拼死一搏，说不定还有些机会。
“……留得青山在不愁没柴烧，咱们兄弟只要站稳了中左所城，就算人船全拼光，照样也能翻过来！”郑芝龙大声说道，“千金散去还复来，咱们兄弟都是做大事的，要有点气魄！”
被他这一番话一激，众人纷纷热血上涌，觉得既然大哥都视财物为草芥，自己更不必患得患失，只要拼命打走琼州营，就不愁没有翻本通吃的机会，毕竟当年他们也曾经被李魁奇逼得几乎到了绝路上，后来照样又翻了回来。
众人一起躬身：“愿唯将军马首！”
布置妥当后，郑芝龙带着亲将亲兵下了城楼，只见城门口闹哄哄的，士兵们都在领取赏银，眼见自家的士兵虽然行列混乱了些，但是一个个衣甲齐全，器械鲜明，比起官兵要强得多了，不由得稍觉慰藉。虽然陆师不是郑家的核心，但是这些年来他也没在上面少投钱，装备军饷一概从优，很是为他打了几次胜仗——还被朝廷抽调到广东打过排瑶。如今他唯一的指望就是在陆战中能够顶住琼州营的最后一击了。
巡视一圈后，他吩咐亲兵：“将马托斯和统太郎叫来。”
马托斯和统太郎是他的黑人卫队和日本人卫队的首脑。郑芝龙的黑人卫队是在葡萄牙人那里招募的，大多数是葡萄牙人的逃奴。
按照记载，当时的澳门“有850个有家室的葡萄牙人，……他们平均有6个武装奴隶。其中数量最大、最优秀的是咖吠哩人，还有其他族人，……葡萄