虚空中，某个世界，日本。
在东京都的西部有一座以科研与教育为主体的城市，高度集中的科研实力让整个城市所使用产品要领先外界20年以上，而遍地的学校也让城市的主要居住人员为各学校的学生。
这里是学园都市，科学侧的大本营。
打着脑部开发的幌子，实则是利用科学的力量开发出超能力，并将超能力进行分级，从level0到level6的七个等级。而用于开发超能力的实验材料正是学园都市中的学生，这些还没有形成完整世界观的年轻孩子们。
某个小巷当中，一道系着两个红色蝴蝶结的隙间打开，一位身着紫色阴阳道袍的金发少女步入学园都市。
“没想到居然在路上就遇到了这样一个世界，那不来看看怎么行呢？”
仅仅是站在原地，那些飘浮于空气中的滞空回线就全部失去作用，让这一片成为某个倒吊男监视区域内的盲区。毕竟紫可不想让那个偷窥一切的家伙看到自己在做什么，偷窥别人这种行为只能自己做，别人可不能干这种事情。
走出小巷，紫第一眼就看到了耸立在那里的无窗无门大楼，那里是亚雷斯塔的住所。
街道上只有少数行人，而且他们的服装也不似学生。现在这个时间点上，学生们应该都在学校上课，商业街上根本不可能出现学生，除非那些逃课的不良少年。
似乎不良少年在任何学校都会存在，即使以超能力开发为主的学园都市也一样。
目送几名不良少年从马路对面跑过，在他们身后还追着几只小狗形态的机器人，那似乎是这个时代的防卫机器人。不良少年们手中提着背包，那是他们从银行抢出来现金，也是引来防卫机器人的主要原因。
微笑着向相反的方向走，紫看到一位少女从天而降。
本应对大地造成破坏的少女很轻巧地落地，压低身体尽力将力道分散到大地。在少女的右臂上挂着一道绿色的臂袖，那是学园都市风纪委员的标志。
落地之后，少女立刻起身，朝着那几名不良少年逃跑的方向追去。
“我是风纪委员！前面的那几个家伙，你们给我站住！”
“谁会站住呀！！”还有心情还嘴，看来这几个不良少年逃跑时还游刃有余。
“给！我！站！住！”
再一次起跳，风纪少女跃至不良少年面前，这一次她并没有控制力量，狠狠地砸到地面。地面如同跷跷板一样被弹起，不良少年们一头撞在竖起的地面，直接撞晕。
随后，警备员们才姗姗来迟，将这些不良少年们押送至专属车辆上，还好好教训了那位风纪少女。
站在人群后看完了整个过程，紫笑了笑，走向无窗无门大楼。
亚雷斯塔感觉很烦躁，就在一个小时之前，滞空回线的某片区域突然出现空白，有什么东西让整个区域内的滞空回线全部失效，没有任何信息传回到自己这边。然而就在亚雷斯塔觉得这是一次魔法侧的偷袭时，他的守护天使艾华斯告诉他一个更加震惊的消息。
神降临了。
作为魔法侧最强的力量，只存在于圣经中的存在，凌驾于所有天使以上的存在――神，已经降临到学园都市。
这就好像勇者刚刚拿到传说中的圣剑，正要开始提升自己的等级，最后关底的大魔王却突然出现在勇者面前。可以说，只要那位神想要抹杀亚雷斯塔，亚雷斯塔现在已经死了。
可是现在已经过去一个小时，亚雷斯塔还活得好好的。
【它到底在想些什么？那个所谓的神怎么会……魔法侧找到降临用的容器了，还是……】
身为曾经最伟大的魔法师，亚雷斯塔很清楚圣经中的天使是怎样的存在，如果没有合适的容器承载天使，天使根本不可能降临于世，更别说圣经中最强的存在――神。
就在亚雷斯塔烦躁地等待神的审判时，魔法侧已经完全乱套了。
神降临于世的消息在第一时间被罗马正教、英国清教、俄罗斯成教获知，然而在他们探明神降临的方位时，却不由得一愣，因为神降临的方位是学园都市，魔法侧敌人科学侧的大本营。
在这等大事面前，三教放弃成见互相交流消息，并以最快的速度搜集了所有魔法侧组织的动向。结果他们发现没有任何一家魔法结社在学园都市有人员活动，而且这一场术式也不是任何一家魔法结社发动的。
也就是说这是圣子降临。
这一下，所有魔法结社都不淡定了，以三教的反应最为激烈，他们立刻召集所有武装力量，准备强攻学园都市。如果说让学园都市掌握圣子，那么今后的世界将会变成科学侧的天下，犹如两千年前耶稣让魔法侧掌握世界两千年一样。
所以，夺回圣子是必须的事情。
除了魔法结社在行动之外，有些人已经提前闯入学园都市，或者将目光投向学园都市。现存于世的准魔神、魔神以及待在相位位面的魔神们，他们已经来到学园都市，要找到降临于世的神。
察觉到有人将视线集中到自己身上，紫不由得回头看向天空，透过重重阻隔看到了相位位面的魔神们。
微微一笑，紫身边打开一道隙间，迈步踏入，只一个瞬间紫就抵达了亚雷斯塔的面前。
看到紫从隙间中走出，亚雷斯塔整个人毫毛都倒立起来。亚雷斯塔知道神降临并非圣子降临，毕竟圣子是不可能熟练掌握自己能力的，而眼前的这位