小亚细亚舰队将领们得知这个消息之后，根本没有信心同战船数量远超过自己的戴奥尼亚三大舰队进行战斗，也顾得上再为陆军提供帮助，即刻决定率领舰队南返。为了避免与戴奥尼亚舰队迎面撞上，在经过开俄斯岛之后，小亚细亚舰队就开始远离海岸，企图向西南方向航行，绕一个大圈，从而避过戴奥尼亚舰队。
谁知道戴奥尼亚舰队长官们为了防止错过敌人，特地安排第二舰队走近海、第一舰队偏远海、第住小亚细亚舰队这条大鱼。
应该说小亚细亚舰队有些幸运，一艘途经的小亚细亚西部城邦商船好意提醒小亚细亚舰队“前方有戴奥尼亚舰队正在向他们行驶而来”，得知消息的波斯将领们顿时慌了神：面对戴奥尼亚舰队的步步紧逼，小亚细亚舰队已经不可能继续向西绕行，否则舰队将深入戴奥尼亚在爱琴海的势力范围，得不到任何补给，很快就会不战自溃，因此摆在他们面前的只有一条路，尽快让舰队靠近小亚细亚海岸，躲进一个城镇的港口，方能避免覆灭的命运。
于是小亚细亚舰队紧急掉头，径直向东急驶，途经萨摩斯岛，在戴奥尼亚舰队追上之前，企图进入以弗所港口。
以弗所是小亚细亚西部沿海的大城，不但城高墙厚，而且物资充裕，小亚细亚舰队完全可以在里面长时间躲避，直到戴奥尼亚舰队不得不离开。
波斯人打的好主意，只可惜戴奥尼亚舰队已有防备，米多拉德斯率领的第二舰队快速穿过了狭窄的萨摩斯海峡，战船在以弗所附近海域呈“一”字展开，以阻截小亚细亚舰队的东逃。
通过快船得知前方情况的小亚细亚舰队将领们面临着前有堵截、后有追兵的危险局面，如同热锅上的蚂蚁，惊慌得不知所措，迫不得已的情况下，带领舰队仓皇逃进了距离他们最近的萨摩斯港。
萨摩斯岛与小亚细亚西部大陆仅有一个狭窄的海峡相隔，这导致它和博斯沃斯岛一样，其实都属于爱欧尼亚岛屿之一，它曾经是雅典建立的提洛同盟的重要成员之一，后来在科林斯战争之后，雅典的实力逐渐恢复，它又再次加入雅典的海上同盟，但雅典被戴奥你亚击败，相比较于远在西地中海、令萨摩斯感到陌生的戴奥尼亚，萨摩斯人更亲近波斯一些，而且后来它又被波斯王为了拉拢小亚细亚西部的希腊人、更快平定叛乱而颁布的一些法令所吸引，最后完全的倒向了波斯。
当小亚细亚舰队逃入港口之后，戴奥尼亚的三大舰队很快就赶到，港口灯塔和哨楼上的哨兵望着铺陈在港口外海面一眼望不到头的戴奥尼亚战船，无不感到头皮发麻。
不过，曾经给小亚细亚舰队提供了十几艘战船的萨默斯人心中抱有侥幸：戴奥尼亚舰队虽然实力强大，但他们毕竟无法从陆地发起进攻，也无法在这里久待，很快就会无奈的离开。