第二日登州镇主力起行，此时的前锋已经在淇河边扎营。林县周围的山上还有无数当日逃散的流寇，有些有数百人，哨骑一经发现，登州镇就派出一支人马去清剿，路上走得很慢，陈新希望尽量让他们赶远些。
卢象升的大名府天雄军留在磁县，清剿那些零散流寇，保定总兵梁甫的保定兵也大部留在河南与北直隶交界地区，防止有漏网之鱼突入北直隶，仅派了一个游击黄永贵带了千余保定兵赶到河南，整个太行山东侧，暂时没有了大股的流寇。
从林县往辉县，沿途入目皆是干裂的土地，除了河流两岸之外，林县的干旱也十分严重，很多地方不是荒芜的问题，而是缺水缺到寸草不生。太行山沿山的部分稍好，有不少的山泉水可以引，洹河沿岸也能做水渠水利设施，再远的地方就根不行了，很多土地抛荒的时间不短，一些士兵去查看后都觉得至少数年无人耕种。
在陈新的前世，著名的红旗渠就在林县，将漳河河水引到了林县的盆地，才算是解决了林县的灌溉为题。不过陈新在林县没有那样的动员力，也耗不起那个时间，只能和当地人民抢滨河田地了，近卫营第三总的一个司留下，以震慑当地的宗族势力，缴获的粮食也大多留在了这里，作为他们的启动资金。
屯务司的人开始在林县磁县等地召集流民，与留下的那批俘虏一起建立屯堡，这个地方就不能像登莱那样修个围墙就了事，必须建起夯土城墙，短时间是无法完工的。另外便是占据土地，陈新给屯务司的指示是。土地有争执的，可以给银子买。
林县那个知县被吕直一番威逼，现在不敢管登州镇的事情，陈新临行前也去拜访了一下，大棒之后又给了点胡萝卜，不过他的说法又变了一下，只说是有些俘虏无法安置，吕监军打算安排他们在林县屯田，到时候照样给林县纳税。是林县一个大大的政绩。
那知县恍然大悟，以为吕直要当地主，于是陈新在中间借了吕直的势，知县被忽悠进去了，他当然也不会去找吕直对质。连连表示要关照那些人，他还连夜查了田册，然后带人去给陈新他们看了争执会比较少的抛荒地，于是林县屯堡的第一步已经走出去了。
留下的一个司带着些俘虏继续在战场各处掩埋尸体，倒不是他们心地好，五六月气候炎热，尸体容易引发疫病。既然他们要在此安营扎寨，那么这就是必须做的，虽然有个随队的农科所吏员说尸体可以肥田，但从官兵到流民都没人愿意把尸体埋到田地里面。官军离开之后。陆续也有逃散的当地居民回乡，此时才发现他们有了一批新邻居。
这个初始的据点对登州是重要的一步，登州镇目前在青州府进行着缓慢的渗透，将那些无主的土地收入治下。以接收越来越多的流民，这种动作与当地肯定有冲突。所以陈新才要让趟地虎不断在青州府制造事端，一来转移官府视线，二来用匪患牵制那些缙绅，而这个时候，他给吴坚忠的命令已经发了出去。
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崇祯六年的五月，官军连续在陕西和河南大捷，斩杀流寇过万，三十六营在太行山两边跑来跑去，想寻一个软柿子，可惜他们都没找到，北方的边军他们对付不了，河南这边的登州镇他们也搞不过，活动范围越来越狭窄。
陈新与曹诏取得联系，两军沿太行两侧齐头并进，防止流寇利用进军的差异往复流窜，但实施起来才发现困难多多，许多流寇流窜进山，这两支强军也是剿不胜剿，太行山脉山峦起伏，那些流寇又没有山寨可打，往往追击一日连人都看不到几个。连登州的步兵都是如此，曹诏的骑兵更费劲，他只得减慢速度慢慢前进。
六月初，陈新带着耿仲明、左良玉等部进入卫辉府，邓玘的川军则比他们还早一些，除了马祥麟老婆张凤仪领着的千名川军外，秦良玉在崇祯三年带来的石柱兵余部都聚集在了卫辉府。
当时秦良玉领石柱兵九千勤王，到现在已经被秦翼明带先走了几千人，没有秦良玉秦翼明这样的主心骨，川兵们也经常鼓噪，嚷着要回乡，此时的蓟镇新兵操练完成，朝廷也担心川兵闹出事情，便同意了他们回家，但要求顺路剿灭流寇。从北直隶到河南途中，陆续有些人马离开先行回乡，现在剩下的大概四千多，邓玘领了两千余，马祥麟和张凤仪各领千余，其中的张凤仪所部已调往怀庆府城。
林县大捷的消息传开后，河南巡抚玄默找到了目标，亲自来带领东路军，集结地定在卫辉府，东路大军云集，计有登州镇团练总兵营四千、登州标营七百、川军四千余、京营五千、昌平兵两千、大名府团练兵两千，河南地毛兵四千。其中战力最强的是登州镇和川军，但两军都是步兵为主力，其他各部营兵不堪大用，可依赖的只有家丁。
在河南的官军人数名义上超过两万，实际上各部有多有少，京营和河南兵有不少空额，左良玉则远远超过，他们按玄默的要求驻扎在辉县，等待巡抚的到来，辉县城外布满军营，
三十六营抗不住北方边军的压力，往西突围被许鼎臣阻截后，他们只能盘踞泽州，通过流动来不断牵制官军，但他们松散的体制很难形成合力，反而被曹诏这样的强军分而击破，形势越来越艰难。不过他们见隙就钻的打法，逼得官军常常要回头追赶，拖延了北路官军的进度。
河南境内的流寇还是混乱