“万岁有旨：自即日起，全城军民暂停一切活动，专心灭鼠。 （ 广告）捕鼠十只，赏银一两；捕鼠百只，赐田一厘；如有利欲熏心、养鼠领赏者，立斩不赦！”
第二天清晨，朱由检这道灭鼠的圣旨就迅速传遍全城。老鼠这东西看似不起眼，胆子既小，又专门偷啃粮食，一直为老百姓所厌恶，“老鼠过街，人人喊打”，就是极其生动的写照。
但是老鼠的生命力顽强，且数量极多、繁殖极快，尽管百姓平日里也会采取一些灭鼠措施，比如养猫、洒老鼠药等等，却是收效甚微。而且老鼠除了偷吃些粮食以外，似乎对人也没什么威胁；不论军民，白天忙了一天累得要死，晚上回房只想休息，也懒得再耗精力和这些难缠的家伙较劲。
可是这次不同，山海关的十余万军民从巡抚府贴出的告示上得知：已经致死百余人的可怕瘟疫，竟是因鼠而起！一时间，不论男女老少，皆是谈鼠色变，同时更增加了老鼠的憎恶之情。
而皇帝的这道圣旨，更是瞬间点燃了十余万军民的灭鼠热情。白花花的银子、可以祖辈相传的田地，谁不想要？再说捕鼠又不是上阵杀敌，只要做好防护措施，不被老鼠传染，男女老少谁都能做。于是十余万人立即行动起来，在山海关城内及野外展开了轰轰烈烈的灭鼠运动。
灭鼠的方法，也是八仙过海，各显神通。最简单的方法是捕鼠夹和捕鼠笼，这东西平常老百姓家中都会有，但一般也就是一两个。这次在丰厚的物质刺激下，仅仅一个白天，全城就赶制出了数万个捕鼠夹、几千个捕鼠笼，投放到老鼠经常出没之处。时间不长，“啪啪”的声音就连续不断地响起来，那些敢于招摇过市的老鼠，有不少惨死在铁夹之下。
但老鼠是很聪明的动物，绝大多数胆子又比较小，上当踩捕鼠夹的只是少数。这时人们又开始对老鼠洞下手，过去发现老鼠洞，一般是用石块堵死；但现在可没人堵了，因为一个老鼠洞，往往就意味着几两银子！
对付老鼠洞的方法也是多种多样，有灌水、灌石灰的，有用烟熏的，有还有直接用铁锨挖的。一旦老鼠被赶出来，在外面等候多时的人们就会抡起铁锨一通猛拍。
在一些老鼠肆虐的重灾区，朱由检还组织官军统一投放剧毒鼠药。其实在前世，因为剧毒鼠药往往会误伤其他动物，甚至是被人误食，因而被严厉禁止；但现在两害相权择其轻，他也顾不了那么多了。
而在野外，对田鼠的捕杀同样进行得热火朝天。现在天气逐渐变暖，本来也到了春耕的时候。人们便借着松土的机会，在田中深挖鼠洞，穷追猛打。田鼠可不像家鼠那么聪明，过去只有菜蛇、猫头鹰等天敌，农户可没怎么对他们下过手。这次突然集体行动，收获可比山海关城内要大多了eads;。
每日到了正午，则要进行上交死鼠、兑换银两的工作。朱由检每次都命人在城外的原野上挖一个大坑，交上来的死鼠全部扔进坑中，一把大火烧个干干净净。当然这个过程必须确保安全，襙作者都裹得里三层外三层，穿得与前世的防化服相仿。
除了灭鼠以外，朱由检对卫生工作也毫不放松。每人每天必须洗澡，所有衣物也都用开水烫过一遍。另外他还借鉴秦王庄的成功经验，对粪便进行统一管理，严厉禁绝随地大小便、随地吐痰。
孙承宗等人见皇帝整日忙于灭鼠和搞卫生，不禁心急如焚。在他们看来，辽东国土一战尽失，如何布置防务才是当前的头等大事。另外皇帝偷着出京这么长时间，现在朝廷已经乱成了一锅粥，也实在不宜在山海关耽搁太久了。
其实这些朱由检都知道，也确实都是重要的急务。但是他还是坚持要等到灭鼠和卫生运动初见成效，再离开山海关返回京师。因为他心里很清楚，鼠疫在历史上给人类造成的灾难太严重了，若不及时制止其扩散，山海关的军民就将遭受灭顶之灾，不用后金来打，自己都有可能死绝，甚至还可能波及全国！
当然朱由检也知道，自己不可能在山海关待太久。因此他这几天一直在给高第、满桂、祖大寿等人上课，告诉他们如何应对鼠疫。
高第等人这才知道，鼠疫是由老鼠和跳蚤联手传播的烈性传染病。跳蚤叮了老鼠以后再叮人，就会把瘟疫传播到人身上。初时会有发热、寒战、被叮咬的部位瘙痒出血等症状，然后病情迅速发展，三四天内就会破坏全身血液，造成死亡。
而这还只是鼠疫的一种传播方法，更为可怕的是，已经感染鼠疫的人，还会以咳嗽、喷嚏的方式，用唾液飞沫将瘟疫传染给其他人，这就是肺鼠疫。染上肺鼠疫后，病猛更为凶猛，甚至可朝发夕死，且病死率高达九成以上。朱由检强令每人必须带口罩，且发病者坚决隔离，原因就在于此。
其实朱由检还没敢告诉他们，在历史上鼠疫曾经有过三次大流行，其中最严重的一次始于十四世纪，单是在欧洲就造成了两千五百万人死亡，整个欧亚大陆更是有近亿人死亡。
明末这个时代，正赶上这次大流行的尾期。据估计，单是华北地区，死于鼠疫的人口就达千万以上。当李自成率领大顺军兵临京师城下时，京师之内尚有两三万守军，但仅用两天就攻陷了这座世界上最坚固的城池，据说也是因为正值城内鼠疫流行，士卒皆无力防守所致，故有“明亡于鼠疫”之说。