蓝玉是功勋卓着的大将，封为凉国公。公元1393年锦衣卫官员告发他谋反。朱元璋也将他杀了。连坐被族诛的有15000多人。所有勇猛的将官几乎在这一案中被杀光。
徐达是第一位开国功臣，一直谨小慎微，柴门不出，使朱元璋一直找不到除掉他的借口。公元1385年，徐达背上生疽。据说，生这种病最忌吃蒸鹅。朱元璋就乘机使臣将蒸鹅赐给他吃。徐达只得流着泪当着使臣的面将蒸鹅吃下去。不久，徐达病故。
朱元璋移交皇权功过都在于立太子。朱元璋吸取元朝前期不设太子引起朝庭多次宫庭政变的教训，在称吴王时，就立了长子朱标为世子。称帝后立为太子。朱元璋聘用着名学者和朝庭重臣教导太子。太子成年后就让他处理政事，学习治国。朱元璋还常常教训他要仁、明、勤、断，这样才能保住天下。但是，朱标天生温文尔雅，俨然是个儒生。他生性忠厚，不赞成父亲大杀功臣。每当朱元璋要杀功臣时，他总要加以劝阻，要求父亲以仁慈为本，顾及亲戚情谊和兄弟友爱。为此，父子经常发生争执。有一次朱元璋要惩处太子老师宋之康。朱标哭着求情。朱元璋发恕说：“等你做了皇帝再赦免他。”太子听后惶恐不安，竟投水自尽而被左右救起。
还有一次，朱标劝谏父亲说：“陛下杀人过滥，恐伤和气。”朱元璋当时不言语。第二天，朱元璋故意将一条剌杖扔到地上，叫朱标拿起来。朱标因为杖上有剌，畏畏缩缩地不敢去拿。朱元璋说：“你是怕剌而不敢拿。我把剌拔掉了再交给你，岂不是好。”朱标说：“上有尧舜之君，下有尧舜之民。”意思是说上有仁君，下有仁民。朱元璋听了大恕，抓起一把椅子朝朱标扔去。吓得朱标逃入内室，从此惊吓成病，抑郁而死。
朱元璋铁定“宗法制”，强保皇权移交太孙。朱元璋早年贫困，中年戎马辛劳，40岁后整日忙于国事，以至到50岁以后就感体力不支，心动过速，又常发高热，好幻想，作怪梦，有时喜恕无常。太子一死，他又伤心过度，身体愈益衰弱。发须全变白了，属于老年痴呆症。他立朱标长子——16岁的朱允?晌??铩肌a?龃娴母涤训隆7胧ぜ肝豢?步韫噬绷恕k?值p亩?锩怯胩?镎?峄饰唬?匾獗嗔恕队兰?肌泛汀痘拭髯嫜怠贰?铀锩亲袷亍白诜ㄖ啤薄29娑a淖嬷凭鸵约槌悸鄞c?裆蔽鹇郏∠m?源耸勾蠹叶挤?有实郏?3种旒一食?某ぞ锰?健?p> 公元1398年闰5月，朱元璋心力交瘁，终于病倒。祭末日，病势加重转危，便立遗诏说他称帝31年来“忧危积心，日勤不怠”。这两句话，既是他一生辛劳的写照，也显露出他处于统治阶级内部激烈斗争之中的心境。遗绍中命太孙朱允?杉涛弧v钭痈髯哉蚴胤槐馗熬┍忌ィ?苑辣涔省矣先眨?煸?安∷烙诰┒嘉鞴??p> 朱元璋死后被益为高皇帝，庙号太祖。
朱元璋生前找了许多画工来画自己的像，画得都很逼真。由于朱元璋相貌不雅，画得越逼真他越不满意。后来，有个画家猜中了他的心思，画得面貌轮廓有些象，脸型和气，看上去很仁慈。这张画朱元璋很满意，命人描了许多份，分赐诸子。所以，明太祖的画像现存有两种版本，一种是他的真面貌；另一种却是美化之笔！
朱元璋信风水源自神缘。朱元璋的墓地是他自己生前选定的。谁也说不清，朱元璋晚年信奉风水，是否与天子岗龙脉圣地有着千丝万缕的“神缘”联系？朱元璋的坟墓座落在南京钟山脚下的玩珠峰。他在选墓地时，见此处北依钟山主峰，西濒玄武湖，如卧龙怀抱着一颗宝珠在玩耍，气势非凡，当即选定。只可惜玩珠峰南面建有孙权墓。挡住了朱元璋的墓道。臣下奏议拆毁孙权墓，以顺风水。朱元璋却说：“别拆了。孙权也是一条好汉。留着他给我站岗吧！”所以，现存的朱元璋墓道不是正南正东，而是转向东偏西。
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